Study Design | Chapter 7
Throughout this guide, you’ve learned about the process of designing and executing a metabolomics study to answer your scientific questions. We first showed you how to determine your study goals and reviewed the available technology. From there, we helped you consider whether to use an untargeted screening or a targeted experimental approach, dove deep into sample types and preparation steps to consider and explained how Metabolon returns your data to you and what you can expect from us throughout the entire process.
You are now equipped to build a metabolomics experimental workflow; we encourage you to refer to the previous chapters of this guide at any time and contact us for further information. Here’s a quick review of the main points of discussion in each chapter that you can use to find what you need quickly:
Su Guía para un Estudio Metabolómico Exitoso equipará a los investigadores para aprovechar la metabolómica en sus laboratorios y flujos de trabajo para una variedad de indicaciones a través de las ciencias de la vida. En concreto, trataremos la selección de metabolitos, el análisis dirigido frente al no dirigido, la tecnología e instrumentación adecuadas, el diseño del estudio, el análisis de controles frente al de variantes, los tipos de muestras, la preparación de muestras y el análisis eficaz de los resultados de la metabolómica.
Before you embark on a metabolomics study, there are several important considerations you should make—especially if you are going to work with a vendor to complete your study. In Chapter 1 of this guide, we arm you with the most important questions you need to ask to select the right vendor and complete your metabolomics study with confidence.
In Chapter 2, we introduce the metabolomics study workflow, providing an overview of study design, sample preparation, sample analysis, and data acquisition, analysis, and interpretation. We also include key considerations for each step so that you can move on to building your metabolomic study with confidence.
In Chapter 3, we take a deep dive into designing your metabolomics study, starting with defining the study objective and approach. We explain the importance of having a sufficiently powered study with careful consideration of controls and data normalization—aspects of experimental design where Metabolon can assist. Finally, we set expectations for the type of data you will receive from your metabolomics study and how to mock up your study to identify any areas of concern using our Study Design Tool or working with your Study Director before sample collection.
In Chapter 4, we introduce the main sample types used for human, animal, and environmentalmetabolomics studies: blood, urine, feces, tissue, and others. We review sample preparation best practices and potential complications for each type, including collection, processing, and contaminant removal.
In Chapter 5, we discuss best practices for sample collection, shipping, and preparation to preserve sample integrity and reduce the risk of data variability, instrument interference, and metabolite degradation.
Junto con el Capítulo 4, el Capítulo 5 ofrece una visión general de los tipos de muestras y consideraciones comunes en el flujo de trabajo de recogida y procesamiento de muestras para garantizar datos metabolómicos reproducibles y de alta calidad.
In Chapter 6, we show you what to expect when you receive your data from Metabolon. A metabolomic study may probe hundreds or thousands of metabolites per sample; by introducing the data analysis and interpretation tools and support you’ll have access to, we unpack what you will receive and how it can be used for further analysis and publication.
This guide has led you through the steps of running a metabolomics study with Metabolon from start to finish. Beyond the tips and considerations presented, you know exactly what support you will receive from your Study Director and Metabolon throughout the process. Contact us today to get started on your metabolomics study!
Una vez que se comprende todo el valor de la metabolómica, la única pregunta que queda es: ¿quién lo hace mejor? Aunque muchos laboratorios cuentan con capacidades para la elaboración de perfiles de metabolitos o de química analítica, las tecnologías de metabolómica integrales son extremadamente escasas.
La identificación precisa e imparcial de los metabolitos en todo el metaboloma plantea retos en cuanto a la relación señal-ruido que muy pocos laboratorios están preparados para afrontar. Además, convertir cantidades ingentes de datos en información útil resulta lento, cuando no imposible, para la mayoría, ya que una interpretación adecuada requiere dos elementos de los que se carece: experiencia y una base de datos exhaustiva.
Gracias a nuestra sólida plataforma y a nuestras herramientas de visualización, nuestros expertos son los únicos capaces de ofrecerle más información sobre su molécula y desarrollar paneles de ensayos que le ayuden a concentrarse en los resultados que necesita.
Cobertura
Capacidad para interrogar a miles de metabolitos a través de diversos espacios bioquímicos, revelando nuevos conocimientos y oportunidades.
Comparabilidad
Capacidad para integrar los datos de diferentes estudios en el mismo conjunto de datos, en diferentes geografías, entre diferentes pacientes a lo largo del tiempo.
Competencia
Capacidad para informar sobre el diseño adecuado de los estudios, generar datos de alta calidad, obtener conocimientos biológicos y formular recomendaciones prácticas.
Capacidad
Capacidad para procesar cientos de miles de muestras de forma rápida y rentable para dar servicio a una demanda en rápido crecimiento.