Study Design | Chapter 6
En el capítulo anterior de esta guía, repasamos los detalles de la recogida de muestras, su almacenamiento antes del transporte y la creación de un protocolo de envío para preservar su integridad durante todo el viaje. Después de haber tomado las medidas necesarias para garantizar que sus muestras lleguen de forma segura a Metabolon, puede confiar en que generarán resultados metabolómicos de la más alta calidad. A continuación, llega el emocionante momento de recibir sus datos. Mientras se sumerge en los números, los científicos Metabolon bolon le ayudarán a convertir sus resultados en una historia. En este capítulo, repasaremos los resultados del análisis, la interpretación y las perspectivas de su estudio.
Your study will reference our in-house database of over 5,400 biologically relevant small molecules, enabling you to detect hundreds or even thousands of metabolites from your samples, depending on which assay(s) you choose to perform. Every single Metabolon customer receives their data presented in a Client Data Table (CDT). When you access the CDT, you won’t just see a table with endless columns and values—you’ll see data you can understand, interpret, and use to further your research objectives.
El CDT, que antes se entregaba en un único archivo, se entrega ahora en tres. Este formato renovado es más fácil de importar a herramientas de procesamiento posteriores, como R o Python. El mapa de calor se separa del CDT en un archivo Excel aparte. Por último, los gráficos se colocan en un PDF. A continuación se describen los tres archivos.
Tabla de datos del cliente. Este archivo Excel con pestañas contiene una lista completamente anotada de todos los metabolitos identificados, valores normalizados, un glosario de términos y los metadatos del estudio. La organización coherente de los datos y los identificadores bioquímicos únicos facilitan la ejecución de los mismos scripts R o Python de un proyecto a otro.
Mapa de calor. También tendrá acceso a un mapa de calor navegable que le permitirá identificar rápidamente los patrones, ya que las sustancias químicas están agrupadas por vías.
Gráficos. Acceda rápidamente a gráficos de caja para cada metabolito identificado en su muestra. Las imágenes del PDF son de alta calidad y están listas para su publicación.
Encontrará más información sobre estas prestaciones en nuestra página Trabajar con nosotros.
La visualización de datos depende de las necesidades de cada cliente. Aunque todos los niveles incluyen el CDT, algunos ensayos se combinan con diversas herramientas de análisis e interpretación, como el portal MyMetabolon y Lipid Surveyor.
Los clientes que opten por los Paneles de Descubrimiento Global pueden optar por el programa MyMetabolon que proporciona acceso bajo demanda a los datos a través de un portal digital siempre activo. Allí podrán acceder a informes personalizados creados por los científicos Metabolon . Estos gráficos, visualizaciones y tablas de estadísticas se centrarán en la información más relevante para su estudio. A través de la interfaz MyMetabolon , podrá interrogar, analizar y crear sofisticadas visualizaciones con sus datos. Dado que las visualizaciones de las vías son interactivas, podrá editar fácilmente los detalles de diseño y color.
El Complex Lipid Targeted Panel incluye acceso a Lipid Surveyor™, una herramienta de descubrimiento de biomarcadores y mapeo de vías para interpretar los resultados de estudios lipidómicos. Una vez identificados los analitos de interés, puede superponer los mapas de calor en diagramas de vías bioquímicas.
Note: The downloadable images from both MyMetabolon and Lipid Surveyor are hi-res and publication-ready.
Los servicios de interpretación de Metabolon son proporcionados por nuestro experimentado equipo de más de 45 directores de estudios de nivel de doctorado, que aprovechan nuestra base de conocimientos de vías bioquímicas patentada y nuestras potentes capacidades bioinformáticas. Nuestro experimentado equipo bioestadístico proporciona análisis estadísticos de sus datos con pruebas de significación univariantes (pruebas t, ANOVA, análisis de medidas repetidas). Este equipo le acompaña en cada paso del camino, ayudándole a poner sus datos en perspectiva y a identificar perspectivas procesables. Trabajamos con usted para profundizar en sus datos, y las colaboraciones entre nuestros clientes y los científicos Metabolon han dado lugar a la publicación de más de 3.000 citas.
Cuando concluya su estudio, el director del mismo le proporcionará apoyo posterior al proyecto y consultas en directo para ayudarle a responder a las preguntas pendientes e informarle sobre los siguientes pasos de su investigación.
Las opciones a explorar pueden incluir la continuación del estudio, la progresión de fase o la preparación de un nuevo estudio relacionado. Una vez que haya completado su estudio (o estudios), le animamos a que colabore con nosotros para mostrar sus conocimientos.
La sección de Recursos de nuestro sitio web ofrece una variedad de historias de éxito de clientes resultantes de estudios centrados en el descubrimiento de biomarcadores, diagnósticos, desarrollo de fármacos y más. Uno de nuestros colaboradores, Seres Therapeutics, aprovechó el Global Discovery Panel deMetabolon tras un resultado insatisfactorio en un estudio clínico de fase II. La información que obtuvieron les permitió mejorar la estrategia de dosificación y los biomarcadores eficaces. Utilizando el Panel de Ácidos Biliares de Metabolon, validado por las Buenas Prácticas Clínicas (BPC), demostraron el mecanismo de acción de su terapia y la relación dosis-respuesta durante un exitoso ensayo de fase III. Esta terapia es ahora la primera basada en microbiomas que recibe la aprobación de la FDA.
Después de leer esta guía, estará listo para comenzar a diseñar y ejecutar su propio estudio metabolómico. También sabrá exactamente qué esperar de Metabolon durante todo el proceso. Póngase en contacto con nosotros hoy mismo para empezar.
Una vez que se comprende todo el valor de la metabolómica, la única pregunta que queda es: ¿quién lo hace mejor? Aunque muchos laboratorios cuentan con capacidades para la elaboración de perfiles de metabolitos o de química analítica, las tecnologías de metabolómica integrales son extremadamente escasas.
La identificación precisa e imparcial de los metabolitos en todo el metaboloma plantea retos en cuanto a la relación señal-ruido que muy pocos laboratorios están preparados para afrontar. Además, convertir cantidades ingentes de datos en información útil resulta lento, cuando no imposible, para la mayoría, ya que una interpretación adecuada requiere dos elementos de los que se carece: experiencia y una base de datos exhaustiva.
Gracias a nuestra sólida plataforma y a nuestras herramientas de visualización, nuestros expertos son los únicos capaces de ofrecerle más información sobre su molécula y desarrollar paneles de ensayos que le ayuden a concentrarse en los resultados que necesita.
Cobertura
Capacidad para interrogar a miles de metabolitos a través de diversos espacios bioquímicos, revelando nuevos conocimientos y oportunidades.
Comparabilidad
Capacidad para integrar los datos de diferentes estudios en el mismo conjunto de datos, en diferentes geografías, entre diferentes pacientes a lo largo del tiempo.
Competencia
Capacidad para informar sobre el diseño adecuado de los estudios, generar datos de alta calidad, obtener conocimientos biológicos y formular recomendaciones prácticas.
Capacidad
Capacidad para procesar cientos de miles de muestras de forma rápida y rentable para dar servicio a una demanda en rápido crecimiento.
Solicite un presupuesto para nuestros servicios, obtenga más información sobre tipos de muestras y procedimientos de manipulación, solicite una carta de apoyo o envíe una pregunta sobre cómo la metabolómica puede hacer avanzar su investigación.
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