Demostración de nuestras herramientas de análisis de datos

Análisis de componentes principales (ACP)

La herramienta PCA es una herramienta valiosa para explorar e interpretar conjuntos de datos metabolómicos complejos, ayudando a la identificación de marcadores biológicamente relevantes y a la comprensión de los mecanismos metabólicos. Esta herramienta intuitiva permite investigar y visualizar fácilmente los datos para responder a preguntas básicas de investigación y puede servir como punto de partida para los investigadores. La herramienta PCA ofrece características personalizables para satisfacer sus necesidades y le permite ser autónomo en la investigación de datos en línea con sus objetivos de investigación. Con esta herramienta, usted tiene un control holístico para interpretar mejor y formar hipótesis del perfil metabolómico de los grupos de estudio e identificar patrones o metabolitos de interés a partir de la visualización y exportación de datos.

Análisis discriminante por mínimos cuadrados parciales (PLS-DA)

PLS-DA desempeña un papel fundamental en el análisis metabolómico, ya que proporciona un potente marco estadístico para desentrañar relaciones complejas en conjuntos de datos de alta dimensión. PLS-DA es un método supervisado de reducción de la dimensionalidad que, a diferencia de PCA, incorpora etiquetas de clase en el análisis. Descubre variables latentes (componentes) que maximizan la separación entre diferentes grupos predefinidos (por ejemplo, sanos frente a enfermos) en los datos. Al proyectar los datos sobre estas variables latentes, PLS-DA captura la varianza y la estructura de correlación en los datos más relevantes para la diferenciación de grupos. Dada su naturaleza supervisada, PLS-DA requiere una cuidadosa parametrización y una comprensión de los datos subyacentes.

Parcela volcánica

El diagrama de volcán es una potente herramienta de visualización que combina la significación estadística con la magnitud del cambio en los niveles de metabolitos para destacar los metabolitos biológicamente más relevantes de su estudio. MetabolonEl diagrama de volcán le permite descargar gráficos de alta resolución listos para su publicación y ofrece funciones personalizables para satisfacer sus necesidades específicas.

Análisis de agrupaciones

La agrupación es un método básico en el campo del análisis de datos y la bioinformática, que se utiliza para agrupar entidades en función de sus similitudes. Esta técnica es crucial para revelar las estructuras inherentes a los datos, lo que a menudo conduce a descubrimientos reveladores en diversos ámbitos científicos. Comprender los matices del clustering puede mejorar significativamente su comprensión de los patrones y relaciones ocultos de sus datos. Nuestra herramienta de análisis de clústeres identifica de forma inteligente los parámetros óptimos de agrupación, lo que facilita el análisis de datos complejos.

Enriquecimiento del itinerario

El análisis de rutas es una potente herramienta de la bioinformática y la biología de sistemas. Proporciona contexto e interpretación de diversas vías biológicas para comprender la compleja interacción de genes, proteínas, metabolitos y otras entidades moleculares. Mediante el análisis de estas vías, los investigadores pueden descubrir cómo funcionan e interactúan los distintos procesos biológicos, lo que permite comprender mejor los mecanismos de las enfermedades y las dianas terapéuticas, entre otras cosas. En esencia, el análisis de vías en metabolómica es indispensable para extraer conocimientos biológicos significativos de intrincadas redes de metabolitos, contribuyendo a avances tanto en la ciencia básica como en la investigación traslacional.

Biomarker Lenses™ (lentes de biomarcadores)

La herramienta Biomarker Lenses™ aplica filtros analíticos avanzados que mejoran la exploración de datos metabolómicos centrándose en metabolitos asociados a funciones biológicas, vías o enfermedades específicas. Los filtros actúan como una lupa, destacando subconjuntos relevantes de datos para un análisis en profundidad. Este enfoque permite cribar la enorme variedad de metabolitos y concentrarse en los que son pertinentes para una determinada investigación biológica. Hay tres tipos de Biomarker Lenses™ disponibles en la plataforma bioinformática de Metabolon:Pathway Biomarker Lenses™, Disease Biomarker Lenses™ y Custom Biomarker Lenses™.

Estadísticas

Las herramientas estadísticas de la Plataforma Bioinformática Integrada de Metabolonproporcionan utilidad y control adicionales para explorar e interpretar sus datos. Estas herramientas permiten a los investigadores crear y comparar diferentes modelos estadísticos, gestionar metadatos y datos de muestra, y eliminar valores atípicos para identificar nuevas perspectivas de los datos. Las nuevas herramientas estadísticas ayudan a descubrir aspectos que pueden quedar ocultos por los valores atípicos, garantizando que los análisis sean precisos y se ajusten a los objetivos de la investigación. Todo está perfectamente integrado con otras herramientas de visualización dentro de la Plataforma Bioinformática Integrada.

Informe del Grupo de expertos Discovery

Dentro del Informe del Panel de Descubrimiento, puede visualizar todos los metabolitos detectados en un gráfico de burbujas. Puede seleccionar comparaciones estadísticas, ajustar el valor p, invertir el cambio de pliegue y buscar un metabolito de interés en la barra de herramientas de la parte superior. También puede explorar los metabolitos significativamente regulados al alza y a la baja. Dentro del gráfico de burbujas, se pueden identificar rápidamente los metabolitos significativos y hacer clic en ellos para obtener más información. El usuario también puede descargar una imagen del gráfico de burbujas para su redistribución fuera del portalMyMetabolon .

Explorador de impacto

Impact Explorer es el siguiente paso para profundizar en sus datos del Discovery Panel. Seleccione hasta seis comparaciones estadísticas para verlas dentro de la visualización del heliograma, que es una reimaginación de un mapa de calor de los cambios de pliegues de metabolitos agrupados por vía y organizados en una vista circular. Puede hacer clic en metabolitos específicos o asociaciones y ver la relación entre los grupos. Además, puede descargar un archivo de imagen para cualquier vista que encuentre interesante en el heliograma.

Buscador de perfiles de metabolitos

El Buscador de Perfiles de Metabolitos puede utilizarse para explorar un metabolito específico o una vía de interés. Se puede acceder a ambos haciendo clic en la pestaña Buscador de Perfiles, o navegando desde la pestaña Informe del Panel de Descubrimiento. En el Buscador de perfiles de metabolitos, puede ver una descripción general del metabolito de interés. Esta página incluye enlaces a PubChem, KEGG y HMDB para más información. También puede ver cómo estaba representado estadísticamente ese metabolito en cada una de las comparaciones del estudio. Por último, también puede ver las asociaciones vinculadas a un metabolito determinado.