Metabolómica no dirigida

La metabolómica no dirigida es un potente método de generación de hipótesis diseñado para estudiar una amplia gama de metabolitos en muestras biológicas. El objetivo es obtener una visión lo más completa posible del metaboloma, lo que supone un reto debido a la diversidad de los metabolitos en cuanto a sus propiedades químicas, concentraciones y funciones biológicas. Un reto importante en la metabolómica no dirigida reside en las etapas de procesamiento de datos y anotación de metabolitos, que son largas y complejas, y a menudo producen características redundantes como fragmentos en la fuente, aductos e isótopos. La plataforma de metabolómica no dirigida deMetabolon aborda estos retos ofreciendo una amplia cobertura, con una biblioteca de referencia que contiene más de 5.400 metabolitos a través de 70 vías bioquímicas principales. Nuestra avanzada línea de procesamiento de datos gestiona eficazmente las características redundantes, garantizando una identificación precisa de los metabolitos. Esta amplitud y precisión permiten la captura de metabolitos conocidos y desconocidos, proporcionando a los investigadores una instantánea metabólica más completa y el potencial para descubrir nuevos conocimientos sobre los procesos biológicos. Nuestro enfoque permite la detección de una amplia gama de compuestos, desde metabolitos comunes a moléculas raras o no caracterizadas previamente, maximizando el potencial de nuevos descubrimientos y la generación de hipótesis en la investigación metabolómica.

Los niveles de confianza en la identificación de metabolitos son cruciales para garantizar la fiabilidad y reproducibilidad de la investigación metabolómica. Estos niveles, establecidos por la Metabolomics Standards Initiative, van del Nivel 1 (máxima confianza) al Nivel 5 (mínima confianza), y reflejan el grado de certeza en la identificación de un metabolito en función de diversos parámetros analíticos. Los niveles de confianza más altos son esenciales para extraer conclusiones precisas, sobre todo en estudios complejos en los que una identificación errónea podría dar lugar a interpretaciones equivocadas de los procesos biológicos o los mecanismos de la enfermedad.

Metabolon aborda esta necesidad crítica empleando un enfoque robusto para la identificación de metabolitos, utilizando la mayor biblioteca de Nivel 1 de la industria metabolómica. Nuestra biblioteca patentada, construida y curada durante más de 20 años, contiene más de 5.400 entradas, de las cuales aproximadamente el 85% (~4.600) son anotaciones de Nivel 1 de alta confianza. Esto contrasta fuertemente con otros proveedores que a menudo anuncian bibliotecas de gran tamaño, pero se basan en la indexación de bases de datos externas en lugar de mantener una biblioteca interna validada. Estas prácticas pueden dar lugar a un aumento de los falsos positivos y negativos, lo que afecta a la reproducibilidad. Metabolon El planteamiento de la Comisión Europea, que combina nuestra amplia biblioteca interna con bases de datos externas cuidadosamente seleccionadas para las anotaciones de nivel 2, mejora significativamente la fiabilidad y la interpretabilidad de los resultados. Esta estrategia de identificación en varios niveles garantiza que los investigadores reciban información precisa y muy útil para sus investigaciones científicas o clínicas.

El análisis y la interpretación de datos son cruciales en metabolómica debido a la complejidad y el volumen de los datos generados. Los experimentos metabolómicos a menudo producen enormes conjuntos de datos que contienen información sobre miles de metabolitos, lo que dificulta la extracción de información biológica significativa sin herramientas analíticas sofisticadas. Los enfoques tradicionales suelen requerir que los investigadores utilicen varios paquetes de software, posean conocimientos de codificación o confíen en los informes estáticos que entregan la mayoría de los proveedores de servicios, lo que puede llevar mucho tiempo y limitar la profundidad del análisis.

Metabolon aborda estos retos con su plataforma bioinformática integrada, que ofrece una solución completa e integral para el análisis y la interpretación de datos metabolómicos. La plataforma integra a la perfección técnicas estadísticas avanzadas con potentes herramientas de visualización, lo que permite a los usuarios alternar sin esfuerzo entre el análisis de componentes principales (ACP), el análisis discriminante de mínimos cuadrados parciales (PLS-DA), los diagramas de volcán y el mapeo de rutas dentro de un único entorno. Este enfoque integrado agiliza el proceso de análisis y mejora la capacidad de obtener información biológica significativa. La interfaz intuitiva de la plataforma y la arquitectura basada en la nube permiten a los investigadores manejar grandes conjuntos de datos sin necesidad de un potente hardware informático, lo que hace que los datos metabolómicos complejos sean accesibles y procesables para una amplia gama de usuarios. Al proporcionar esta solución unificada y fácil de usar, Metabolon permite a los investigadores centrarse en la comprensión de la biología que impulsa sus datos, acelerando el descubrimiento y facilitando una investigación metabolómica más completa.