Secuenciación metagenómica
Emparejar la secuenciación metagenómica con la metabolómica para obtener una visión completa de la función del microbioma
La integración de la secuenciación metagenómica con la metabolómica vincula la composición microbiana con los resultados funcionales para profundizar en el conocimiento del impacto del microbioma en la salud del huésped.
- Opciones de secuenciación de Flexile
- Potentes herramientas bioinformáticas para la integración de datos
- Los metabolitos como resultado fenotípico de la composición de la comunidad microbiana
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Análisis multiómico del microbioma
Revelar el impacto del microbioma en la salud del huésped
En la actualidad se reconoce ampliamente que el microbioma es un factor clave de la salud humana, que influye significativamente en la inmunidad, el metabolismo y la susceptibilidad a las enfermedades. Por ello, la biología del microbioma se ha convertido, con razón, en un tema clave en diversos campos de la investigación biomédica. Una herramienta fundamental en este campo es la secuenciación metagenómica, que se viene utilizando desde hace tiempo para evaluar la composición de las comunidades microbianas y, más recientemente, para caracterizar el potencial de codificación genética del microbioma mediante la secuenciación shotgun profunda.
Aunque la metagenómica identifica las especies microbianas y su potencial genético, no capta sus contribuciones funcionales -lo que metabolizan activamente- que afectan al huésped. La metabolómica, la medida del repertorio de moléculas pequeñas presentes en una muestra, aborda esta carencia proporcionando una lectura fenotípica de la actividad del microbioma. Al integrar la metagenómica con la metabolómica, los investigadores pueden comprender mejor la composición microbiana, su función y su impacto en la salud del huésped.
Opciones de secuenciación metagenómica
La selección de la opción correcta de secuenciación metagenómica es esencial para lograr los objetivos del estudio, equilibrando el coste y la profundidad de los conocimientos necesarios para responder a sus preguntas de investigación. Metabolon ofrece múltiples opciones de secuenciación metagenómica, incluyendo secuenciación de amplicones 16S y secuenciación Shotgun a varias profundidades optimizadas para muestras fecales. Obtenga más información sobre nuestras opciones de secuenciación aquí. Al entender en profundidad los objetivos y el presupuesto de un estudio, Metabolon puede ayudar a seleccionar la opción de secuenciación metagenómica que ofrece el mejor valor y conocimientos para avanzar en sus objetivos de investigación.
Secuenciación de amplicones (16S)
La secuenciación de amplicones permite evaluar la composición de la comunidad microbiana mediante la secuenciación de regiones características del gen 16S rRNA para clasificar arqueas y bacterias.
Secuenciación Shotgun, superficial (3 millones de lecturas)
Para investigaciones preliminares o estudios centrados en tendencias microbianas generales, la opción Poco Profundo puede ser a menudo suficiente para explorar la composición de la comunidad y las diferencias entre grupos. Esta opción proporciona un medio rentable de obtener datos adecuados para identificar especies y patrones dominantes.
Secuenciación Shotgun, Balance (15 millones de lecturas)
La opción Equilibrio ofrece un buen equilibrio entre el coste y la profundidad de los conocimientos. Esta opción proporciona una visión general tanto de las especies dominantes como de algunas menos abundantes y comienza a representar el potencial de función génica codificado por la comunidad microbiana.
Secuenciación Shotgun, profunda (20 millones de lecturas)
Para detectar especies microbianas raras o realizar análisis muy detallados de funciones génicas, las opciones Deep y Ultra Deep proporcionan los mayores niveles de detalle. La opción Deep proporciona una cobertura en profundidad para captar una mayor diversidad de especies, microbios raros y funciones génicas raras.
Secuenciación Shotgun, ultraprofunda (80 millones de lecturas)
Esta opción proporciona una resolución ultra alta, capaz de capturar especies raras, genes raros y sutiles diferencias funcionales debidas a pequeñas variaciones en la secuencia genética. Esta opción puede beneficiar sobre todo a los investigadores que cuentan con su propio equipo de bioinformática para aprovechar al máximo la información funcional disponible en esta profundidad de datos.
Nuestra solución para la investigación del microbioma
La Solución de Investigación del Microbioma de Metabolones una oferta completa de servicios para la generación de datos metabolómicos y metagenómicos de alta calidad, el análisis de datos multiómicos de fácil uso y la interpretación biológica que puede acelerar su investigación del microbioma.
Global Discovery Panel
Metabolonpuede detectar e identificar hasta 5.400 metabolitos en una sola muestra biológica.
Panel del microbioma
Un panel metabolómico altamente seleccionado que busca más de 400 pequeñas moléculas clave para acelerar el descubrimiento del microbioma.
Herramienta de análisis del microbioma
Unifique los datos metagenómicos, metabolómicos y fenotípicos en una plataforma accesible y sin código que simplifica los análisis complejos.
Recursos destacados
Obtenga más información sobre cómo la metabolómica y la metagenómica pueden ayudarle a comprender mejor el impacto del microbioma en la salud.
Folleto electrónico: Global Discovery Panel
Webinar en directo: Desentrañar los secretos del microbioma
Libro Blanco: Guía para la secuenciación metagenómica
