Study Design | Introduction

Your Guide to a Successful Metabolomics Study

¿Qué es esta Guía?

Studies document the connection between metabolites and an array of disease states, making the comprehensive analysis of metabolomics data important for research in both diagnostics and therapeutics.1,2 In particular, research over the past decade increasingly demonstrates the impact of cellular-level analysis on characterizing the pathogenesis of various disorders.3,4 As such, incorporating metabolomics into research workflows can offer insights for research indications throughout the life sciences, including atherosclerosis, Alzheimer’s disease, cardiovascular diseases, diabetes, age-related macular degeneration, infertility, osteoporosis, multiple sclerosis, Niemann-Pick disease type C, Parkinson’s disease, and cancers.5,6

¿Quién debería leer esto?

El reciente crecimiento de los estudios ómicos ha creado oportunidades para que los investigadores principales y los directores de laboratorio exploren los beneficios de aprovechar los ensayos metabolómicos y los datos fenotípicos. A medida que los estudios metabolómicos se vuelven más accesibles a una gama más amplia de objetivos de estudio, esta guía debería ser beneficiosa para las personas en todo el continuo de las ciencias de la vida, desde investigadores metabolómicos experimentados hasta genetistas, farmacólogos e investigadores del cáncer. La creciente importancia de la metabolómica para la investigación independiente y los resultados multiómicos hace que una comprensión fundamental de cómo desarrollar un estudio metabolómico exitoso sea importante para todos los científicos analíticos.

¿Qué aprenderás?

Su Guía para un Estudio Metabolómico Exitoso equipará a los investigadores para aprovechar la metabolómica en sus laboratorios y flujos de trabajo para una variedad de indicaciones a través de las ciencias de la vida. En concreto, trataremos la selección de metabolitos, el análisis dirigido frente al no dirigido, la tecnología e instrumentación adecuadas, el diseño del estudio, el análisis de controles frente al de variantes, los tipos de muestras, la preparación de muestras y el análisis eficaz de los resultados de la metabolómica.

Resumen de los capítulos

  1. Top 8 Questions to Ask Your Metabolomics Provider: The most important questions you need to ask to find the right vendor and complete your metabolomics study with confidence.
  2. Metabolomics Study Workflow: A discussion of key considerations for study design, sample preparation, and data analysis and interpretation.
  3. Building Your Metabolomic Study: A deep dive into designing your study — including defining your aims, study power, controls, and study size — to ensure your protocol delivers high-quality results for drawing actionable insights.
  4. Sample Types for Metabolomics: A closer look at the most common types of samples used in metabolomic studies and collection, transportation, and storage considerations and best practices for each.
  5. Metabolomics Sample Preparation, Storage, and Transportation: Best practices for sample collection, shipping, and preparation to preserve sample integrity and reduce the risk of data variability, instrument interference, and metabolite degradation.
  6. Metabolomics Study Analysis, Interpretation, and Insights: An in-depth look at the data analysis and interpretation tools and support you’ll have access to when performing your metabolomics study with Metabolon.
  7. The End of This Guide, The Beginning of Your Own Metabolomics Studies: Here’s a quick review of the main points of discussion in each chapter that you can use to find what you need quickly.

Implicaciones de los metabolitos para la investigación

Dada la eficacia de la metabolómica en la investigación del estado de las enfermedades, las empresas aplican cada vez más herramientas de metabolómica en sus estudios. Metabolon ofrece varias metodologías de apoyo al análisis metabolómico para la investigación en ciencias de la vida, incluidos paneles y ensayos específicos que abarcan más de 1.000 metabolitos y lípidos en una amplia gama de clases bioquímicas, rutas metabólicas y procesos fisiológicos, y que pueden personalizarse para adaptarse mejor a cualquier aplicación.

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Referencias

  1. Surendran P, Stewart ID, Au Yeung VPW, et al. Determinantes genéticos raros y comunes de la individualidad metabólica y sus efectos en la salud humana. Nat Med 28, 2321-2332 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-02046-0
  2. Lotta LA, Pietzner M, Stewart ID, et al. A cross-platform approach identifies genetic regulators of human metabolism and health. Nat Genet 53, 54-64 (2021). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00751-5
  3. Biringer RG. The Role of Eicosanoids in Alzheimer's Disease (El papel de los eicosanoides en la enfermedad de Alzheimer). Int J Environ Res Public Health. 2019 Jul 18;16(14):2560. doi: 10.3390/ijerph16142560. PMID: 31323750; PMCID: PMC6678666.
  4. Solito E, Sastre M. Función de la microglía en la enfermedad de Alzheimer. Front. Pharmacol. 2012;3 doi: 10.3389/fphar.2012.00014.
  5. Samadi A, Sabuncuoglu S, Samadi M, Isikhan SY, Chirumbolo S, Peana M, Lay I, Yalcinkaya A, Bjørklund G. A Comprehensive Review on Oxysterols and Related Diseases. Curr Med Chem. 2021; 28(1): 110-136. doi: 10.2174/0929867327666200316142659.
  6. de Freitas FA, Levy D, Reichert CO, Cunha-Neto E, Kalil J, Bydlowski SP. Efectos de los Oxisteroles en las Células Inmunes y Enfermedades Relacionadas. Cells. 2022; 11(8): 1251. https://doi.org/10.3390/cells11081251

Vea cómo Metabolon puede avanzar en su camino hacia los conocimientos preclínicos y clínicos

Un científico maneja un espectrómetro de masas

¿Por qué Metabolon?

Una vez que se comprende todo el valor de la metabolómica, la única pregunta que queda es: ¿quién lo hace mejor? Aunque muchos laboratorios cuentan con capacidades para la elaboración de perfiles de metabolitos o de química analítica, las tecnologías de metabolómica integrales son extremadamente escasas.

La identificación precisa e imparcial de los metabolitos en todo el metaboloma plantea retos en cuanto a la relación señal-ruido que muy pocos laboratorios están preparados para afrontar. Además, convertir cantidades ingentes de datos en información útil resulta lento, cuando no imposible, para la mayoría, ya que una interpretación adecuada requiere dos elementos de los que se carece: experiencia y una base de datos exhaustiva.

Asóciese con Metabolon para acceder:

  • Una biblioteca con más de 5.400 metabolitos conocidos, 2.000 de ellos en plasma humano, todos ellos referenciados en el contexto de las vías bioquímicas. Eso supone cinco veces más metabolitos que el competidor más cercano.
  • Una experiencia sin igual, tanto en profundidad como en amplitud, en el análisis y la interpretación de datos metabolómicos para obtener resultados significativos
    • Más de 10.000 proyectos con cientos de clientes
    • Más de 3.500 publicaciones sobre 500 enfermedades, incluidas numerosas revistas especializadas como Cell, Nature y Science.
    • Casi 40 doctores en ciencia de datos, biología molecular y bioquímica

Gracias a nuestra sólida plataforma y a nuestras herramientas de visualización, nuestros expertos son los únicos capaces de ofrecerle más información sobre su molécula y desarrollar paneles de ensayos que le ayuden a concentrarse en los resultados que necesita.

Solo Metabolon las cuatro capacidades fundamentales en el ámbito de la metabolómica:

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