Capítulo 0 - Guía para el éxito de un estudio metabolómico

¿Qué es esta Guía?

Los estudios documentan la conexión entre los metabolitos y una serie de estados patológicos, lo que hace que el análisis exhaustivo de los datos metabolómicos sea importante para la investigación tanto diagnóstica como terapéutica^.1,2 En particular, las investigaciones de la última década demuestran cada vez más el impacto del análisis a nivel celular en la caracterización de la patogénesis de diversos trastornos^.3,4 Por ello, la incorporación de la metabolómica a los flujos de trabajo de investigación puede ofrecer información para indicaciones de investigación en todas las ciencias de la vida, como la aterosclerosis, la enfermedad de Alzheimer, las enfermedades cardiovasculares, la diabetes, la degeneración macular asociada a la edad, la infertilidad, la osteoporosis, la esclerosis múltiple, la enfermedad de Niemann-Pick tipo C, la enfermedad de Parkinson y el cáncer^.5,6

¿Quién debería leer esto?

El reciente crecimiento de los estudios ómicos ha creado oportunidades para que los investigadores principales y los directores de laboratorio exploren los beneficios de aprovechar los ensayos metabolómicos y los datos fenotípicos. A medida que los estudios metabolómicos se vuelven más accesibles a una gama más amplia de objetivos de estudio, esta guía debería ser beneficiosa para las personas en todo el continuo de las ciencias de la vida, desde investigadores metabolómicos experimentados hasta genetistas, farmacólogos e investigadores del cáncer. La creciente importancia de la metabolómica para la investigación independiente y los resultados multiómicos hace que una comprensión fundamental de cómo desarrollar un estudio metabolómico exitoso sea importante para todos los científicos analíticos.

¿Qué aprenderás?

Su Guía para un Estudio Metabolómico Exitoso equipará a los investigadores para aprovechar la metabolómica en sus laboratorios y flujos de trabajo para una variedad de indicaciones a través de las ciencias de la vida. En concreto, trataremos la selección de metabolitos, el análisis dirigido frente al no dirigido, la tecnología e instrumentación adecuadas, el diseño del estudio, el análisis de controles frente al de variantes, los tipos de muestras, la preparación de muestras y el análisis eficaz de los resultados de la metabolómica.

Resumen de los capítulos

1. Las 8 preguntas más importantes que debe hacer a su proveedor de metabolómica: Las preguntas más importantes que debe hacer para encontrar el proveedor adecuado y completar su estudio metabolómico con confianza.
2. Flujo de trabajo del estudio metabolómico: Un análisis de las consideraciones clave para el diseño de estudios, la preparación de muestras y el análisis e interpretación de datos.
3. Creación de su estudio metabolómico: Una inmersión profunda en el diseño de su estudio - incluyendo la definición de sus objetivos, la potencia del estudio, los controles, y el tamaño del estudio - para asegurar que su protocolo ofrece resultados de alta calidad para la extracción de información procesable.
4. Tipos de muestras para metabolómica: Una mirada más cercana a los tipos más comunes de muestras utilizadas en los estudios metabolómicos y las consideraciones de recolección, transporte y almacenamiento y las mejores prácticas para cada uno.
5. Preparación, almacenamiento y transporte de muestras metabolómicas: Mejores prácticas de recogida, envío y preparación de muestras para preservar su integridad y reducir el riesgo de variabilidad de los datos, interferencias de los instrumentos y degradación de metabolitos.
6. Análisis, interpretación y perspectivas del estudio metabolómico: Una mirada en profundidad a las herramientas de análisis e interpretación de datos y el apoyo al que tendrá acceso al realizar su estudio metabolómico con Metabolon.
7. El final de esta guía, el comienzo de sus propios estudios metabolómicos: He aquí un repaso rápido de los principales puntos de discusión de cada capítulo que puede utilizar para encontrar rápidamente lo que necesita.

Implicaciones de los metabolitos para la investigación

Dada la eficacia de la metabolómica en la investigación del estado de las enfermedades, las empresas aplican cada vez más herramientas de metabolómica en sus estudios. Metabolon ofrece varias metodologías de apoyo al análisis metabolómico para la investigación en ciencias de la vida, incluidos paneles y ensayos específicos que abarcan más de 1.000 metabolitos y lípidos en una amplia gama de clases bioquímicas, rutas metabólicas y procesos fisiológicos, y que pueden personalizarse para adaptarse mejor a cualquier aplicación.

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Referencias

1. Surendran P, Stewart ID, Au Yeung VPW, et al. Determinantes genéticos raros y comunes de la individualidad metabólica y sus efectos en la salud humana. Nat Med 28, 2321-2332 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-02046-0
2. Lotta LA, Pietzner M, Stewart ID, et al. A cross-platform approach identifies genetic regulators of human metabolism and health. Nat Genet 53, 54-64 (2021). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00751-5
3. Biringer RG. The Role of Eicosanoids in Alzheimer's Disease (El papel de los eicosanoides en la enfermedad de Alzheimer). Int J Environ Res Public Health. 2019 Jul 18;16(14):2560. doi: 10.3390/ijerph16142560. PMID: 31323750; PMCID: PMC6678666.
4. Solito E, Sastre M. Función de la microglía en la enfermedad de Alzheimer. Front. Pharmacol. 2012;3 doi: 10.3389/fphar.2012.00014.
5. Samadi A, Sabuncuoglu S, Samadi M, Isikhan SY, Chirumbolo S, Peana M, Lay I, Yalcinkaya A, Bjørklund G. A Comprehensive Review on Oxysterols and Related Diseases. Curr Med Chem. 2021; 28(1): 110-136. doi: 10.2174/0929867327666200316142659.
6. de Freitas FA, Levy D, Reichert CO, Cunha-Neto E, Kalil J, Bydlowski SP. Efectos de los Oxisteroles en las Células Inmunes y Enfermedades Relacionadas. Cells. 2022; 11(8): 1251. https://doi.org/10.3390/cells11081251