Soluciones biofarmacéuticas

Haga avanzar su investigación clínica y preclínica con la metabolómica

Las empresas farmacéuticas y biotecnológicas tienen un objetivo importante: lograr el éxito clínico. La introducción de la metabolómica en su flujo de trabajo favorece este objetivo al reducir el riesgo de fracaso.

Enfoque su investigación

Las empresas farmacéuticas pioneras necesitan una lente única que ponga orden en la gran cantidad de datos que generan. La genómica, la proteómica, los inmunoensayos, los inmunofenotipos, los paneles de citoquinas y otros métodos tienen todos su lugar a la hora de proporcionar una lectura funcional de su terapia, pero aplicarlos de forma dispersa puede ser más abrumador que esclarecedor. Esta avalancha de datos no sólo es difícil de destilar en una comprensión significativa, sino que también consume mucho tiempo durante un período en el que no tiene tiempo de sobra. La metabolómica puede ofrecer una solución completa y fiable para los flujos de trabajo biofarmacéuticos.

Profundizar en los conocimientos multiómicos con la metabolómica

La metabolómica refleja la actividad bioquímica dentro de las células y, por tanto, representa con mayor precisión el estado funcional del sistema durante el tratamiento. Integra muchas otras fuentes de datos, como las mediciones clínicas y la genómica, proporcionando una visión más profunda que la que puede lograrse sin la metabolómica. Como representante definitivo de un fenotipo, es la pieza final de la multiómica y es clave para la biología de sistemas.
Clínicos que analizan los datos

Soluciones para flujos de trabajo biofarmacéuticos

Un artículo publicado recientemente en Current Opinion in Toxicology, titulado "Confidence in Metabolite Identification Dictates the Applicability of Metabolomics to Regulatory Toxicology", parte de esta idea al sugerir, a efectos de los estudios toxicológicos, que "...una 'triangulación' multiómica de este tipo, tanto de la expresión génica ascendente como de la función descendente de metabolitos y lípidos, no sólo ayudaría a corroborar las identidades de las entidades moleculares, sino que proporcionaría una mayor confianza en la importancia de una determinada vía bioquímica en respuesta a una sustancia química."1 La incomparable biblioteca mundial de metabolitos y paneles biofarmacéuticos de Metabolonpodría ayudarle a extraer conclusiones de los estudios con mayor rapidez y confianza.

Algunas preguntas habituales a las que puede responder la metabolómica son:

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¿Qué modelo es más traducible o pertinente?
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¿Existe una clara señal farmacodinámica (PD) y de eficacia en mi modelo animal?
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¿Dispongo de biomarcadores sanguíneos para monitorizar la EP y la eficacia, incluso en modelos que no sean roedores?
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¿Se trasladarán los biomarcadores a los seres humanos?
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¿Dispongo de datos que respalden un mecanismo de acción claro y convincente?
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¿Cómo se compara mi molécula con la de los competidores en la indicación prevista?
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¿Tienen los biomarcadores el potencial de seleccionar subgrupos para los ensayos o de identificar respondedores?
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¿Cuál es el camino más claro hacia el hito de desarrollo?

Vea cómo Metabolon puede avanzar en su camino hacia los conocimientos preclínicos y clínicos

Permitir el conocimiento en todas las fases del desarrollo de fármacos

Nuestros paneles cuantitativos, disponibles de inmediato o desarrollados a medida, le ayudan a alcanzar sus objetivos de investigación y validación de biomarcadores con métodos precisos y totalmente validados. Nuestros paneles específicos y ensayos de un solo analito cubren más de 1000 metabolitos y lípidos en una amplia gama de clases bioquímicas, rutas metabólicas y procesos fisiológicos, y se pueden personalizar para adaptarse mejor a cualquier aplicación.

Potenciar la toma de decisiones eficaz

La metabolómica enriquece la toma de decisiones en investigación y desarrollo debido a las propiedades fundamentales de lo que estudia: el metaboloma, es decir, todas las pequeñas sustancias bioquímicas (metabolitos) que circulan por el organismo o una célula. La metabolómica es especialmente importante para aportar claridad a la investigación y el desarrollo de fármacos, porque casi todas las influencias que afectan a los procesos fisiológicos (enfermedad, biología de la diana, actividad fuera de la diana) afectan al metaboloma. De ahí que la medición con metabolómica proporcione un informe consensuado de la acción molecular en el contexto del modelo utilizado. Por último, debido a que el metaboloma y las rutas metabólicas están tan ampliamente mapeadas, este informe de consenso es fácilmente interpretable. Metabolon facilita este proceso.
Potenciar la toma de decisiones eficaz
sistemas metabolómicos patentados

Hacer avanzar la ciencia

Metabolon ofrece servicios de metabolómica a lo largo de todo el proceso de investigación, desde el descubrimiento hasta la cuantificación de biomarcadores y el desarrollo de pruebas diagnósticas. Nuestro equipo de expertos trabaja con usted para desarrollar un diseño de estudio a medida que satisfaga sus necesidades de investigación en todas las áreas de las ciencias de la vida. Metabolon ha sido pionera en Precision Metabolomics, la tecnología global de metabolómica y lipidómica más completa de la industria. Nos hemos basado en esta tecnología y experiencia para ofrecer también el Complex Lipids Targeted Panel y paneles predesarrollados y personalizados para la investigación y los ensayos clínicos.

Aumentar las probabilidades de éxito de la investigación

Muchos laboratorios tienen capacidades de perfilado de metabolitos o de química analítica, pero ninguno cuenta con la extensa biblioteca de estándares de metabolitos o sistemas informáticos que potencian la plataforma de Metabolon. Metabolon ha obtenido más de 200 patentes que cubren su tecnología, métodos y una creciente cartera de biomarcadores. Nuestra experiencia inigualable y nuestros sistemas de metabolómica patentados garantizan que nuestros clientes reciban la imagen más precisa y completa del metaboloma.

Hacer avanzar la ciencia
Buenas prácticas clínicas (BPC)

Estrategias para el desarrollo de biomarcadores

Metabolon guía a sus clientes para garantizar la integridad del estudio y la generación de datos de alta calidad a través de todas las fases del proceso de desarrollo de biomarcadores de conformidad con las normas reglamentarias. De acuerdo con el contexto de uso de sus biomarcadores, podemos proporcionar validación Fit-For-Purpose de nuestros paneles específicos, y tenemos la capacidad de adherirnos a las normas de Buenas Prácticas Clínicas (GCP) / Buenas Prácticas de Laboratorio Clínico (GCLP) con una amplia validación de métodos de acuerdo con la Guía de Validación de Métodos Bioanalíticos de la FDA, 2018 o la Directriz de la EMA sobre Validación de Métodos Bioanalíticos, 2011.

Garantizar la integridad de los datos

Metabolon ofrece una garantía de calidad y un control de calidad de última generación en todas las fases, un riguroso programa de gestión de datos y el cumplimiento de las normas y reglamentos federales e internacionales de Estados Unidos.

Nuestro sólido sistema de gestión de calidad (SGC) va más allá de la garantía y el control de calidad internos e incluye certificaciones externas y el cumplimiento de dichas normas. Todos los procedimientos que llevamos a cabo, incluida la gestión de muestras, el análisis de datos, el mantenimiento de instrumentos, la cualificación de reactivos y la validación de métodos, se rigen por un sistema de gestión de la calidad con certificación ISO 9001:2015.

Sistema de gestión de la calidad (SGC) de Metabolon
Confirme sus datos genómicos, de ARN-seq y de proteínas

Aplicar una gobernanza de datos rigurosa

Todos los datos experimentales e instrumentales generados son supervisados automáticamente por nuestro software de control de calidad y, a continuación, inspeccionados y verificados manualmente por nuestro experimentado personal de laboratorio.

Nuestro laboratorio está certificado por la Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) y acreditado por las normas del College of American Pathologists (CAP) para realizar pruebas de diagnóstico en muestras humanas. Aplicamos un riguroso programa de gestión de datos basado en los principios de integridad de datos, privacidad de datos, seguridad de datos y cumplimiento de la legislación aplicable en materia de privacidad de datos.

"La metabolómica está claramente vinculada al genotipo y, lo que es más interesante, al fenotipo. Permite una visión única de las relaciones entre genes, expresión génica, entornos, estilos de vida, microbiomas, tratamientos y patologías".2

WILLETTE ET AL. 2021

Cómo Metabolon ayuda a mejorar el diseño de los ensayos y contribuye a su éxito

Merck Research Laboratories y Schering-Plough Research Institute: los marcadores de toxicidad renal aguda permiten seleccionar quimiotipos menos tóxicos.

Durante la fase inicial de desarrollo de una molécula dirigida a un nuevo objetivo para reducir el colesterol, el Dr. Kevin B. Alton y su equipo de los Laboratorios de Investigación Merck trabajaron con el Dr. Walter Korfmacher, Miembro Distinguido, y el Dr. Ganfeng Wang, Científico Principal, en el Instituto de Investigación Schering-Plough, donde el cribado metabolómico reveló marcadores asociados a la insuficiencia renal aguda en ratones. Los marcadores convencionales no señalaban claramente el problema ni lo explicaban. Los biomarcadores metabolómicos proporcionaron la seguridad de que los efectos estaban claramente fuera del objetivo, y estos marcadores se utilizaron para examinar otros quimiotipos con el fin de demostrar que la toxicidad estaba aislada de un quimiotipo concreto. Así se abrió una posible vía de avance para el programa. Este ejemplo pone de relieve el peligro de basarse únicamente en marcadores establecidos, ya que resultaron ineficaces para reflejar y explicar la toxicidad. En cambio, las huellas dactilares metabolómicas aportaron claridad y un camino a seguir.3,4

Gilead Sciences: biomarcadores sanguíneos sencillos para evaluar la respuesta se suman a las herramientas de desarrollo en EHNA

Los criterios de valoración de los ensayos de esteatohepatitis no alcohólica (EHNA) presentan muchos inconvenientes, entre ellos la fiabilidad. Se buscan biomarcadores sanguíneos sencillos. La necesidad se ve amplificada por el gran número de dianas novedosas que se barajan para la EHNA, por lo que es fundamental saber con rapidez si el programa va en la dirección correcta (es decir, si se ha alcanzado el objetivo o hay indicios de eficacia). Aprovechando la metabolómica, el Dr. Rohit Loomba, MD, MHSc, Director del Centro de Investigación de NAFLD de la UC San Diego, y su equipo colaboraron con Gilead Sciences y otros para reforzar la confianza en que iban por buen camino en su exitoso ensayo de fase II de GS-0976, descubriendo varios marcadores metabólicos de eficacia. Estos biomarcadores pueden acompañar el desarrollo futuro para leer la actividad farmacodinámica o la respuesta del GS-0976.5

Lea el estudio de caso

¿Está interesado en ampliar estudios?

¿Por qué Metabolon?

Una vez que se ha visto todo el valor de la metabolómica, la única pregunta que queda es: ¿quién lo hace mejor? Aunque muchos laboratorios cuentan con capacidades de perfilado de metabolitos o de química analítica, las tecnologías metabolómicas completas son extremadamente escasas. La identificación precisa e imparcial de metabolitos en todo el metaboloma plantea problemas de relación señal-ruido que muy pocos laboratorios están preparados para afrontar. Además, traducir cantidades masivas de datos en información procesable es lento, si no imposible, para la mayoría, porque una interpretación adecuada requiere dos cosas que escasean: experiencia y una base de datos completa.

Sólo Metabolon dispone de las cuatro funciones básicas de la metabolómica

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Cobertura

Capacidad para interrogar a miles de metabolitos a través de diversos espacios bioquímicos, revelando nuevos conocimientos y oportunidades.

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Comparabilidad

Capacidad para integrar los datos de diferentes estudios en el mismo conjunto de datos, en diferentes geografías, entre diferentes pacientes a lo largo del tiempo.

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Competencia

Capacidad para informar sobre el diseño adecuado de los estudios, generar datos de alta calidad, obtener conocimientos biológicos y formular recomendaciones prácticas.

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Capacidad

Capacidad para procesar cientos de miles de muestras de forma rápida y rentable para dar servicio a una demanda en rápido crecimiento.

Asóciese con Metabolon para acceder:

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Una biblioteca de más de 5.400 metabolitos conocidos, 2.000 en plasma humano, todos ellos referenciados en el contexto de vías bioquímicas.

  • Eso es 5 veces los metabolitos del competidor más cercano
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Profundidad y amplitud de experiencia sin precedentes en el análisis y la interpretación de datos metabolómicos para encontrar resultados significativos.

  • Más de 10.000 proyectos con cientos de clientes
  • Más de 3.500 publicaciones sobre 500 enfermedades, incluidas numerosas revistas especializadas como Cell, Nature y Science.
  • Casi 40 doctores en ciencia de datos, biología molecular y bioquímica

Gracias a nuestra sólida plataforma y a nuestras herramientas de visualización, nuestros expertos son los únicos capaces de ofrecerle más información sobre su molécula y desarrollar paneles de ensayos que le ayuden a concentrarse en los resultados que necesita.

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Referencias

1. Malinowska JM, Viant MR. La confianza en la identificación de metabolitos dicta la aplicabilidad de la metabolómica a la toxicología reguladora. Opinión actual en toxicología. 2019/08/01/ 2019;16:32-38. doi:10.1016/j.cotox.2019.03.006

2. Frédérich M, Pirotte B, Fillet M, de Tullio P. Metabolomics as a Challenging Approach for Medicinal Chemistry and Personalized Medicine. Journal of medicinal chemistry. 2016;59 19:8649-8666.

3. Zgoda-Pols JR, Chowdhury S, Wirth M, Milburn MV, Alexander DC, Alton KB. Metabolomics analysis reveals elevation of 3-indoxyl sulfate in plasma and brain during chemically-induced acute kidney injury in mice: investigation of nicotinic acid receptor agonists. Toxicol Appl Pharmacol. Aug 15 2011;255(1):48-56. doi:10.1016/j.taap.2011.05.015

4. Wang G, Korfmacher WA. Development of a biomarker assay for 3-indoxyl sulfate in mouse plasma and brain by liquid chromatography/tandem mass spectrometry. Rapid Commun Mass Spectrom. Jul 2009;23(13):2061-9. doi:10.1002/rcm.4111

5. Loomba R, Kayali Z, Noureddin M, et al. GS-0976 reduce la esteatosis hepática y los marcadores de fibrosis en pacientes con enfermedad del hígado graso no alcohólico. Gastroenterology. Nov 2018;155(5):1463-1473.e6. doi:10.1053/j.gastro.2018.07.027

Referencias

1. Zgoda-Pols, J.R., et al., El análisis metabolómico revela un aumento del sulfato de 3-indoxilo en plasma y cerebro durante la lesión renal aguda inducida químicamente en ratones: estudio de los agonistas de los receptores de ácido nicotínico. Toxicol Appl Pharmacol, 2011. 255(1): p. 48-56.

2. Bryant, J. A. y otros, «El impacto de un tratamiento oral a base de microbioma purificado en el microbioma gastrointestinal». *Nat Med*, 2026, 32(1): pp. 186-196

3. McGovern, B. H. y otros, «SER-109, un fármaco experimental basado en el microbioma para reducir la recurrencia tras la infección por Clostridioides difficile: conclusiones extraídas de un ensayo de fase II». Clin Infect Dis, 2021, 72(12): pp. 2132-2140.

4. Feuerstadt, P., et al., «SER-109, una terapia oral basada en el microbioma para la infección recurrente por Clostridioides difficile». N Engl J Med, 2022. 386(3): págs. 220-229.

5. Hu, Z., et al., «La metabolómica dirigida revela nuevos biomarcadores diagnósticos para el cáncer colorrectal». Mol Oncol, 2025. 19(6): p. 1737-1750.

6. Butler, F. M. y otros, «Los patrones alimentarios vegetarianos y los metabolitos relacionados con la dieta se asocian con la función renal en la cohorte del Estudio Adventista de la Salud 2». J Ren Nutr, 2025.

7. Stanford, J., et al., «Perfil metabolómico y puntuación de la calidad de la dieta en un ensayo cruzado aleatorizado sobre patrones alimentarios saludables y habituales». Mol Nutr Food Res, 2025. 69(23): p. e70271.

8. O’Connor, L.E., et al., Perfil metabolómico de un patrón alimentario ultraprocesado en un ensayo alimentario cruzado, aleatorizado y controlado realizado en el domicilio. J Nutr, 2023. 153(8): p. 2181-2192.

9. Fritsch, D. A. y otros, «La función del microbioma sustenta la eficacia de una intervención dietética con suplementos de fibra en perros con diarrea crónica del intestino grueso». BMC Vet Res, 2022. 18(1): p. 245.

10. Leal, L. N. y otros, «El aporte de nutrientes antes del destete mejora la productividad durante la lactancia y reduce el riesgo de sacrificio en vacas Holstein». J Dairy Sci, 2025. 108(6): págs. 5875-5888.

11. Ahsin, M., et al., «La salud del suelo y los pastos es la base de la mayor densidad nutricional de la carne de vacuno, según un análisis metabolómico no dirigido realizado en sistemas de engorde con pastoreo del sur de EE. UU.». NPJ Sci Food, 2025. 9(1): p. 151.

12. Yin, W., et al., Perfil lipídico plasmático en diferentes especies para la identificación de modelos animales óptimos de la dislipidemia humana. J Lipid Res, 2012. 53(1): p. 51-65.

13. Porter, F. D. et al., «Los productos de la oxidación del colesterol son biomarcadores sanguíneos sensibles y específicos para la enfermedad de Niemann-Pick tipo C1». Sci Transl Med, 2010, 2(56): p. 56ra81.

14. Needham, B. D. y otros, «Perfiles de metabolitos plasmáticos y fecales en el trastorno del espectro autista». Biol Psychiatry, 2021, 89(5): págs. 451-462

15. Li, C. y otros, «El estradiol y mTORC2 cooperan para potenciar la biosíntesis de prostaglandinas y la tumorigénesis en células LAM con deficiencia de TSC2». J Exp Med, 2014. 211(1): págs. 15-28.

16. Green, P. G. y otros, «Flexibilidad metabólica y remodelación inversa del corazón humano con insuficiencia». Eur Heart J, 2025. 46(25): pp. 2422-2433.

17. Maekawa, H., et al., La inhibición de SGLT2 protege la función renal mediante la represión epigenética, dependiente de SAM, de los genes inflamatorios en condiciones de estrés metabólico. J Clin Invest, 2025. 135(19).

18. Wu, D., et al., Los cribados integrados revelan que la disminución de los nucleótidos de guanina, que resulta irreversible al actuar sobre la IMPDH2, inhibe el cáncer de páncreas y potencia la inhibición de KRAS. Gut, 2026.

19. Schwerdtfeger, L. A. y otros, La microbiota intestinal y los metabolitos están relacionados con la progresión de la enfermedad en la esclerosis múltiple. Cell Reports Medicine, 2025. 6(4): p. 102055.

20. Wu, H., et al., Dinámica del microbioma y el metaboloma asociada al deterioro del control de la glucosa y a las respuestas a los cambios en el estilo de vida. Nat Med, 2025. 31(7): p. 2222-2231.

21. Jacobs, J.P., et al., «La terapia cognitivo-conductual para el síndrome del intestino irritable induce alteraciones bidireccionales en el eje cerebro-intestino-microbioma asociadas a la mejora de los síntomas gastrointestinales». Microbiome, 2021. 9(1): p. 236.

22. Pietzner, M., et al., «Metabolitos plasmáticos para perfilar las vías en la multimorbilidad de las enfermedades no transmisibles». Nat Med, 2021. 27(3): p. 471-479.

23. Faquih, T.O., et al., «Predicción metabolómica robusta de la edad basada en una amplia selección de metabolitos». J Gerontol A Biol Sci Med Sci, 2025, 80(3).

24. Scherer, N., et al., La combinación de la metabolómica y la secuenciación del exoma revela efectos graduales de variantes heterocigotas raras y perjudiciales sobre la función génica y los rasgos humanos. Nat Genet, 2025. 57(1): p. 193-205.

25. Holmes, Z.C., et al., «El análisis metabolómico no dirigido de la leche materna de madres sanas revela los factores que determinan la variabilidad de los metabolitos». Sci Rep, 2024. 14(1): p. 20827.

26. Titz, B., et al., «Implicaciones de los factores de confusión oculares en los análisis proteómicos y metabolómicos del humor acuoso en las enfermedades de la retina». Transl Vis Sci Technol, 2024. 13(6): p. 17.

27. Bloom, S. M. y otros, «La dependencia de la cisteína de Lactobacillus iners es una posible diana terapéutica para la modulación de la microbiota vaginal». Nat Microbiol, 2022, 7(3): pp. 434-450.

28. Leimer, E. M. y otros, «Perfil lipídico del líquido sinovial humano tras una fractura intraarticular de tobillo». J Orthop Res, 2017, 35(3): págs. 657-666.