Study Design | Chapter 7

The Beginning of Your Own Metabolomics Studies

Throughout this guide, you’ve learned about the process of designing and executing a metabolomics study to answer your scientific questions. We first showed you how to determine your study goals and reviewed the available technology. From there, we helped you consider whether to use an untargeted screening or a targeted experimental approach, dove deep into sample types and preparation steps to consider and explained how Metabolon returns your data to you and what you can expect from us throughout the entire process.

You are now equipped to build a metabolomics experimental workflow; we encourage you to refer to the previous chapters of this guide at any time and contact us for further information. Here’s a quick review of the main points of discussion in each chapter that you can use to find what you need quickly:

Chapitre 0 : Votre guide pour une étude métabolomique réussie

Your Guide to a Successful Metabolomic Study permettra aux chercheurs d'exploiter la métabolomique dans leurs laboratoires et leurs flux de travail pour une variété d'indications dans l'ensemble des sciences de la vie. Nous aborderons notamment la sélection des métabolites, l'analyse ciblée ou non, la technologie et l'instrumentation appropriées, la conception de l'étude, l'analyse du contrôle ou des variantes, les types d'échantillons, la préparation des échantillons et l'analyse efficace des résultats de la métabolomique.

Chapter 1: Top 8 Questions to Ask Your Metabolomics Provider

Before you embark on a metabolomics study, there are several important considerations you should make—especially if you are going to work with a vendor to complete your study. In Chapter 1 of this guide, we arm you with the most important questions you need to ask to select the right vendor and complete your metabolomics study with confidence.

Chapitre 2 : Flux d'études métabolomiques

In Chapter 2, we introduce the metabolomics study workflow, providing an overview of study design, sample preparation, sample analysis, and data acquisition, analysis, and interpretation. We also include key considerations for each step so that you can move on to building your metabolomic study with confidence.

Chapitre 3 : Construire votre étude métabolomique

In Chapter 3, we take a deep dive into designing your metabolomics study, starting with defining the study objective and approach. We explain the importance of having a sufficiently powered study with careful consideration of controls and data normalization—aspects of experimental design where Metabolon can assist. Finally, we set expectations for the type of data you will receive from your metabolomics study and how to mock up your study to identify any areas of concern using our Study Design Tool or working with your Study Director before sample collection.

Chapitre 4 : Types d'échantillons

In Chapter 4, we introduce the main sample types used for human, animal, and environmentalmetabolomics studies: blood, urine, feces, tissue, and others. We review sample preparation best practices and potential complications for each type, including collection, processing, and contaminant removal.

Chapitre 5 : Préparation, stockage et transport des échantillons

In Chapter 5, we discuss best practices for sample collection, shipping, and preparation to preserve sample integrity and reduce the risk of data variability, instrument interference, and metabolite degradation.

Avec le chapitre 4, le chapitre 5 fournit une vue d'ensemble des types d'échantillons et des considérations communes dans la collecte et le traitement des échantillons afin de garantir des données métabolomiques reproductibles et de haute qualité.

Chapitre 6 : Analyse, interprétation et perspectives de l'étude

In Chapter 6, we show you what to expect when you receive your data from Metabolon. A metabolomic study may probe hundreds or thousands of metabolites per sample; by introducing the data analysis and interpretation tools and support you’ll have access to, we unpack what you will receive and how it can be used for further analysis and publication.

Quelle est la prochaine étape ?

This guide has led you through the steps of running a metabolomics study with Metabolon from start to finish. Beyond the tips and considerations presented, you know exactly what support you will receive from your Study Director and Metabolon throughout the process. Contact us today to get started on your metabolomics study!

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Un scientifique utilise un spectromètre de masse

Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a pris la mesure de toute la valeur de la métabolomique, la seule question qui reste est la suivante : qui la maîtrise le mieux ? Si de nombreux laboratoires disposent de capacités en matière de profilage métabolique ou de chimie analytique, les technologies de métabolomique complètes sont extrêmement rares.

L'identification précise et impartiale des métabolites à l'échelle de l'ensemble du métabolome pose des défis en matière de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de relever. De plus, la transformation de quantités massives de données en informations exploitables est un processus lent, voire impossible, pour la plupart d'entre eux, car une interprétation correcte nécessite deux éléments qui font défaut : l'expérience et une base de données exhaustive.

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

  • Une base de données comprenant plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 présents dans le plasma humain, tous répertoriés dans le cadre des voies biochimiques. Cela représente cinq fois plus de métabolites que chez le concurrent le plus proche.
  • Une expérience d'une ampleur et d'une profondeur inégalées dans l'analyse et l'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats pertinents
    • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
    • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
    • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

Metabolon la seule entreprise Metabolon des quatre compétences fondamentales en métabolomique :