Study Design | Chapter 6

Analyse, interprétation et perspectives de l'étude métabolomique

Dans le chapitre précédent de ce guide, nous avons abordé les spécificités de la collecte de vos échantillons, de leur stockage avant le transport et de la création d'un protocole d'expédition pour préserver leur intégrité tout au long du voyage. Ayant pris les mesures nécessaires pour que vos échantillons arrivent en toute sécurité chez Metabolon, vous pouvez être sûr qu'ils produiront des résultats métabolomiques de la plus haute qualité. Vient ensuite le moment excitant où vos données vous sont renvoyées ! Alors que vous vous plongez dans les chiffres, les scientifiques de Metabolon vous aideront à transformer vos résultats en une histoire. Dans ce chapitre, nous passerons en revue les résultats de l'analyse, de l'interprétation et de la compréhension de votre étude.

Receiving Your Metabolomics Data

Your study will reference our in-house database of over 5,400 biologically relevant small molecules, enabling you to detect hundreds or even thousands of metabolites from your samples, depending on which assay(s) you choose to perform. Every single Metabolon customer receives their data presented in a Client Data Table (CDT). When you access the CDT, you won’t just see a table with endless columns and values—you’ll see data you can understand, interpret, and use to further your research objectives.

Autrefois unique, le CDT est désormais livré sous la forme de trois fichiers. Ce format remanié se prête mieux à l'importation dans des outils de traitement en aval, tels que R ou Python. La carte thermique est séparée du CDT dans un fichier Excel distinct. Enfin, les graphiques sont placés dans un fichier PDF. Les descriptions de chacun des trois fichiers sont présentées ci-dessous.

Tableau des données du client. Ce fichier Excel à onglets contient une liste entièrement annotée de tous les métabolites identifiés, des valeurs normalisées, un glossaire et les métadonnées de l'étude. L'organisation cohérente des données et les identifiants biochimiques uniques facilitent l'exécution des mêmes scripts R ou Python d'un projet à l'autre.

Carte thermique. Vous aurez également accès à une carte thermique navigable qui vous permettra d'identifier rapidement les tendances, les produits chimiques étant regroupés par voie d'exposition.

Graphiques. Accédez rapidement aux diagrammes en boîte pour chaque métabolite identifié dans votre échantillon. Les images du PDF sont de haute qualité et prêtes à être publiées.

De plus amples informations sur ces résultats sont disponibles sur notre page Travailler avec nous.

Metabolomics Study Comparison

La visualisation des données est échelonnée en fonction des besoins de chaque client. Bien que chaque niveau comprenne le CDT, certains tests sont associés à divers outils d'analyse et d'interprétation, tels que le portail MyMetabolon et le Lipid Surveyor.

Les clients qui choisissent les panels de découverte mondiaux peuvent opter pour le programme MyMetabolon qui offre un accès à la demande aux données par le biais d'un portail numérique permanent. Vous pouvez y accéder à des rapports personnalisés créés par les scientifiques de Metabolon . Ces graphiques, visualisations et tableaux de statistiques se concentrent sur les informations les plus pertinentes pour votre étude. Grâce à l'interface MyMetabolon , vous pourrez interroger, analyser et créer des affichages sophistiqués à partir de vos données. Comme les visualisations des voies sont interactives, vous pouvez facilement modifier les détails de la mise en page et de la couleur.

Le panel ciblé sur les lipides complexes comprend l'accès à Lipid Surveyor™, un outil de découverte de biomarqueurs et de cartographie des voies pour interpréter les résultats des études lipidomiques. Une fois que vous avez identifié les analytes d'intérêt, vous pouvez superposer les cartes thermiques sur des diagrammes de voies biochimiques.

Note: The downloadable images from both MyMetabolon and Lipid Surveyor are hi-res and publication-ready.

Metabolomics Data Interpretation Support: Determining Insights

Les services d'interprétation des Metabolon sont fournis par notre équipe expérimentée de plus de 45 directeurs d'étude titulaires d'un doctorat, qui s'appuient sur notre base de connaissances exclusive des voies biochimiques et sur nos puissantes capacités bioinformatiques. Notre équipe biostatistique expérimentée fournit une analyse statistique de vos données avec des tests de signification univariés (tests t, ANOVA, analyse de mesures répétées). Cette équipe vous accompagne tout au long du processus, vous aidant à mettre vos données en perspective et à identifier des informations exploitables. Nous travaillons avec vous pour approfondir vos données, et les collaborations entre nos clients et les scientifiques de Metabolon ont conduit à la publication de plus de 3 000 citations.

Metabolomics Study Success

À la fin de votre étude, votre directeur d'étude vous fournira un soutien post-projet et une consultation en direct afin de répondre aux questions en suspens et d'éclairer les prochaines étapes de votre recherche.

Les options à explorer peuvent inclure la poursuite de l'étude, la progression de la phase ou la préparation d'une nouvelle étude connexe. Une fois que vous aurez terminé votre étude (ou vos études), nous vous encourageons à collaborer avec nous pour mettre en valeur vos connaissances.

La section Ressources de notre site Web présente une variété d'histoires de réussite de clients résultant d'études axées sur la découverte de biomarqueurs, les diagnostics, le développement de médicaments, et plus encore. L'un de nos collaborateurs, Seres Therapeutics, s'est appuyé sur le Global Discovery Panel deMetabolon après avoir obtenu des résultats insatisfaisants lors d'un essai clinique de phase II. Les informations recueillies ont permis d'améliorer la stratégie de dosage et de mettre au point des biomarqueurs efficaces. En utilisant le panel ciblé sur les acides biliaires de Metabolon, validé par les bonnes pratiques cliniques (BPC), ils ont démontré le mécanisme d'action de leur traitement et la relation dose-réponse au cours d'un essai de phase III couronné de succès. Ce traitement est maintenant le premier traitement à base de microbiome à recevoir l'approbation de la FDA.

Quelle est la prochaine étape ?

Après avoir parcouru ce guide, vous êtes prêt à commencer à concevoir et à exécuter votre propre étude métabolomique. Vous savez également exactement ce que vous pouvez attendre de Metabolon tout au long du processus. Contactez-nous dès aujourd'hui pour commencer !

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Un scientifique utilise un spectromètre de masse

Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a pris la mesure de toute la valeur de la métabolomique, la seule question qui reste est la suivante : qui la maîtrise le mieux ? Si de nombreux laboratoires disposent de capacités en matière de profilage métabolique ou de chimie analytique, les technologies de métabolomique complètes sont extrêmement rares.

L'identification précise et impartiale des métabolites à l'échelle de l'ensemble du métabolome pose des défis en matière de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de relever. De plus, la transformation de quantités massives de données en informations exploitables est un processus lent, voire impossible, pour la plupart d'entre eux, car une interprétation correcte nécessite deux éléments qui font défaut : l'expérience et une base de données exhaustive.

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

  • Une base de données comprenant plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 présents dans le plasma humain, tous répertoriés dans le cadre des voies biochimiques. Cela représente cinq fois plus de métabolites que chez le concurrent le plus proche.
  • Une expérience d'une ampleur et d'une profondeur inégalées dans l'analyse et l'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats pertinents
    • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
    • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
    • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

Metabolon la seule entreprise Metabolon des quatre compétences fondamentales en métabolomique :

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Demandez un devis pour nos services, obtenez plus d'informations sur les types d'échantillons et les procédures de manipulation, demandez une lettre de soutien ou posez une question sur la façon dont la métabolomique peut faire avancer votre recherche.

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