Chapitre 6 - Analyse, interprétation et perspectives de l'étude métabolomique

Réception des données métabolomiques

Votre étude fera référence à notre base de données interne de plus de 5 400 petites molécules biologiquement pertinentes, ce qui vous permettra de détecter des centaines, voire des milliers de métabolites à partir de vos échantillons, selon le(s) test(s) que vous choisirez d'effectuer. Chaque client de Metabolon reçoit ses données dans un tableau de données client (CDT). Lorsque vous accédez au CDT, vous ne verrez pas seulement un tableau avec une infinité de colonnes et de valeurs - vous verrez des données que vous pourrez comprendre, interpréter et utiliser pour faire avancer vos objectifs de recherche.

Autrefois unique, le CDT est désormais livré sous la forme de trois fichiers. Ce format remanié se prête mieux à l'importation dans des outils de traitement en aval, tels que R ou Python. La carte thermique est séparée du CDT dans un fichier Excel distinct. Enfin, les graphiques sont placés dans un fichier PDF. Les descriptions de chacun des trois fichiers sont présentées ci-dessous.

Tableau des données du client. Ce fichier Excel à onglets contient une liste entièrement annotée de tous les métabolites identifiés, des valeurs normalisées, un glossaire et les métadonnées de l'étude. L'organisation cohérente des données et les identifiants biochimiques uniques facilitent l'exécution des mêmes scripts R ou Python d'un projet à l'autre.

Carte thermique. Vous aurez également accès à une carte thermique navigable qui vous permettra d'identifier rapidement les tendances, les produits chimiques étant regroupés par voie d'exposition.

Graphiques. Accédez rapidement aux diagrammes en boîte pour chaque métabolite identifié dans votre échantillon. Les images du PDF sont de haute qualité et prêtes à être publiées.

De plus amples informations sur ces résultats sont disponibles sur notre page Travailler avec nous.

Comparaison des études métabolomiques

La visualisation des données est échelonnée en fonction des besoins de chaque client. Bien que chaque niveau comprenne le CDT, certains tests sont associés à divers outils d'analyse et d'interprétation, tels que le portail MyMetabolon et le Lipid Surveyor.

Les clients qui choisissent les panels de découverte mondiaux peuvent opter pour le programme MyMetabolon qui offre un accès à la demande aux données par le biais d'un portail numérique permanent. Vous pouvez y accéder à des rapports personnalisés créés par les scientifiques de Metabolon . Ces graphiques, visualisations et tableaux de statistiques se concentrent sur les informations les plus pertinentes pour votre étude. Grâce à l'interface MyMetabolon , vous pourrez interroger, analyser et créer des affichages sophistiqués à partir de vos données. Comme les visualisations des voies sont interactives, vous pouvez facilement modifier les détails de la mise en page et de la couleur.

Le panel ciblé sur les lipides complexes comprend l'accès à Lipid Surveyor™, un outil de découverte de biomarqueurs et de cartographie des voies pour interpréter les résultats des études lipidomiques. Une fois que vous avez identifié les analytes d'intérêt, vous pouvez superposer les cartes thermiques sur des diagrammes de voies biochimiques.

Remarque : les images téléchargeables de MyMetabolon et de Lipid Surveyor sont en haute résolution et prêtes à être publiées.

Aide à l'interprétation des données métabolomiques : Déterminer les perspectives

Les services d'interprétation des Metabolon sont fournis par notre équipe expérimentée de plus de 45 directeurs d'étude titulaires d'un doctorat, qui s'appuient sur notre base de connaissances exclusive des voies biochimiques et sur nos puissantes capacités bioinformatiques. Notre équipe biostatistique expérimentée fournit une analyse statistique de vos données avec des tests de signification univariés (tests t, ANOVA, analyse de mesures répétées). Cette équipe vous accompagne tout au long du processus, vous aidant à mettre vos données en perspective et à identifier des informations exploitables. Nous travaillons avec vous pour approfondir vos données, et les collaborations entre nos clients et les scientifiques de Metabolon ont conduit à la publication de plus de 3 000 citations.

Succès de l'étude métabolomique

À la fin de votre étude, votre directeur d'étude vous fournira un soutien post-projet et une consultation en direct afin de répondre aux questions en suspens et d'éclairer les prochaines étapes de votre recherche.

Les options à explorer peuvent inclure la poursuite de l'étude, la progression de la phase ou la préparation d'une nouvelle étude connexe. Une fois que vous aurez terminé votre étude (ou vos études), nous vous encourageons à collaborer avec nous pour mettre en valeur vos connaissances.

La section Ressources de notre site Web présente une variété d'histoires de réussite de clients résultant d'études axées sur la découverte de biomarqueurs, les diagnostics, le développement de médicaments, et plus encore. L'un de nos collaborateurs, Seres Therapeutics, s'est appuyé sur le Global Discovery Panel deMetabolon après avoir obtenu des résultats insatisfaisants lors d'un essai clinique de phase II. Les informations recueillies ont permis d'améliorer la stratégie de dosage et de mettre au point des biomarqueurs efficaces. En utilisant le panel ciblé sur les acides biliaires de Metabolon, validé par les bonnes pratiques cliniques (BPC), ils ont démontré le mécanisme d'action de leur traitement et la relation dose-réponse au cours d'un essai de phase III couronné de succès. Ce traitement est maintenant le premier traitement à base de microbiome à recevoir l'approbation de la FDA.

Quelle est la prochaine étape ?

Après avoir parcouru ce guide, vous êtes prêt à commencer à concevoir et à exécuter votre propre étude métabolomique. Vous savez également exactement ce que vous pouvez attendre de Metabolon tout au long du processus. Contactez-nous dès aujourd'hui pour commencer !