Study Design | Introduction

Your Guide to a Successful Metabolomics Study

Qu'est-ce que ce guide ?

Studies document the connection between metabolites and an array of disease states, making the comprehensive analysis of metabolomics data important for research in both diagnostics and therapeutics.1,2 In particular, research over the past decade increasingly demonstrates the impact of cellular-level analysis on characterizing the pathogenesis of various disorders.3,4 As such, incorporating metabolomics into research workflows can offer insights for research indications throughout the life sciences, including atherosclerosis, Alzheimer’s disease, cardiovascular diseases, diabetes, age-related macular degeneration, infertility, osteoporosis, multiple sclerosis, Niemann-Pick disease type C, Parkinson’s disease, and cancers.5,6

Qui devrait lire ce document ?

La croissance récente des études basées sur les sciences omiques a créé des opportunités pour les chercheurs principaux et les directeurs de laboratoire d'explorer les avantages de l'exploitation des essais métabolomiques et des données phénotypiques. Les études métabolomiques devenant de plus en plus accessibles à un plus grand nombre d'objectifs d'étude, ce guide devrait être utile à tous ceux qui travaillent dans le domaine des sciences de la vie, qu'il s'agisse de chercheurs chevronnés en métabolomique, de généticiens, de pharmacologues ou de chercheurs en cancérologie. L'importance croissante de la métabolomique pour la recherche indépendante et les résultats multi-omiques fait qu'une compréhension fondamentale de la manière de développer une étude métabolomique réussie est importante pour tous les scientifiques analytiques.

Qu'allez-vous apprendre ?

Your Guide to a Successful Metabolomic Study permettra aux chercheurs d'exploiter la métabolomique dans leurs laboratoires et leurs flux de travail pour une variété d'indications dans l'ensemble des sciences de la vie. Nous aborderons notamment la sélection des métabolites, l'analyse ciblée ou non, la technologie et l'instrumentation appropriées, la conception de l'étude, l'analyse du contrôle ou des variantes, les types d'échantillons, la préparation des échantillons et l'analyse efficace des résultats de la métabolomique.

Les chapitres en un coup d'œil

  1. Top 8 Questions to Ask Your Metabolomics Provider: The most important questions you need to ask to find the right vendor and complete your metabolomics study with confidence.
  2. Metabolomics Study Workflow: A discussion of key considerations for study design, sample preparation, and data analysis and interpretation.
  3. Building Your Metabolomic Study: A deep dive into designing your study — including defining your aims, study power, controls, and study size — to ensure your protocol delivers high-quality results for drawing actionable insights.
  4. Sample Types for Metabolomics: A closer look at the most common types of samples used in metabolomic studies and collection, transportation, and storage considerations and best practices for each.
  5. Metabolomics Sample Preparation, Storage, and Transportation: Best practices for sample collection, shipping, and preparation to preserve sample integrity and reduce the risk of data variability, instrument interference, and metabolite degradation.
  6. Metabolomics Study Analysis, Interpretation, and Insights: An in-depth look at the data analysis and interpretation tools and support you’ll have access to when performing your metabolomics study with Metabolon.
  7. The End of This Guide, The Beginning of Your Own Metabolomics Studies: Here’s a quick review of the main points of discussion in each chapter that you can use to find what you need quickly.

Implications des métabolites pour la recherche

Compte tenu de l'efficacité de la métabolomique dans la recherche sur les états pathologiques, les entreprises utilisent de plus en plus d'outils métaboliques dans leurs études. Metabolon propose plusieurs méthodologies pour soutenir l'analyse métabolomique dans les efforts de recherche dans l'ensemble des sciences de la vie, y compris des panels et des essais ciblés qui couvrent plus de 1 000 métabolites et lipides dans un large éventail de classes biochimiques, de voies métaboliques et de processus physiologiques, et qui peuvent être personnalisés pour s'adapter au mieux à n'importe quelle application.

Vous êtes prêt à découvrir les nouvelles connaissances que la métabolomique peut apporter à votre recherche ? Contactez-nous dès aujourd'hui pour en savoir plus.

Références

  1. Surendran P, Stewart ID, Au Yeung VPW, et al. Rare and common genetic determinants of metabolic individuality and their effects on human health. Nat Med 28, 2321-2332 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-02046-0
  2. Lotta LA, Pietzner M, Stewart ID, et al. Une approche multiplateforme identifie les régulateurs génétiques du métabolisme humain et de la santé. Nat Genet 53, 54-64 (2021). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00751-5
  3. Biringer RG. Le rôle des eicosanoïdes dans la maladie d'Alzheimer. Int J Environ Res Public Health. 2019 Jul 18;16(14):2560. doi : 10.3390/ijerph16142560. PMID : 31323750 ; PMCID : PMC6678666.
  4. Solito E, Sastre M. Microglia function in Alzheimer's disease. Front. Pharmacol. 2012;3 doi : 10.3389/fphar.2012.00014.
  5. Samadi A, Sabuncuoglu S, Samadi M, Isikhan SY, Chirumbolo S, Peana M, Lay I, Yalcinkaya A, Bjørklund G. A Comprehensive Review on Oxysterols and Related Diseases. Curr Med Chem. 2021 ; 28(1) : 110-136. doi : 10.2174/0929867327666200316142659.
  6. de Freitas FA, Levy D, Reichert CO, Cunha-Neto E, Kalil J, Bydlowski SP. Effets des oxystérols sur les cellules immunitaires et les maladies associées. Cells. 2022 ; 11(8) : 1251. https://doi.org/10.3390/cells11081251

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Un scientifique utilise un spectromètre de masse

Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a pris la mesure de toute la valeur de la métabolomique, la seule question qui reste est la suivante : qui la maîtrise le mieux ? Si de nombreux laboratoires disposent de capacités en matière de profilage métabolique ou de chimie analytique, les technologies de métabolomique complètes sont extrêmement rares.

L'identification précise et impartiale des métabolites à l'échelle de l'ensemble du métabolome pose des défis en matière de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de relever. De plus, la transformation de quantités massives de données en informations exploitables est un processus lent, voire impossible, pour la plupart d'entre eux, car une interprétation correcte nécessite deux éléments qui font défaut : l'expérience et une base de données exhaustive.

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

  • Une base de données comprenant plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 présents dans le plasma humain, tous répertoriés dans le cadre des voies biochimiques. Cela représente cinq fois plus de métabolites que chez le concurrent le plus proche.
  • Une expérience d'une ampleur et d'une profondeur inégalées dans l'analyse et l'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats pertinents
    • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
    • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
    • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

Metabolon la seule entreprise Metabolon des quatre compétences fondamentales en métabolomique :

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