Chapitre 0 - Votre guide pour une étude métabolomique réussie

Qu'est-ce que ce guide ?

Les études documentent le lien entre les métabolites et toute une série de maladies, ce qui rend l'analyse complète des données métabolomiques importante pour la recherche diagnostique et thérapeutique^.1,2 En particulier, les recherches menées au cours de la dernière décennie démontrent de plus en plus l'impact de l'analyse au niveau cellulaire sur la caractérisation de la pathogenèse de divers troubles^.3,4 Ainsi, l'intégration de la métabolomique dans les flux de travail de la recherche peut offrir des perspectives pour des indications de recherche dans l'ensemble des sciences de la vie, notamment l'athérosclérose, la maladie d'Alzheimer, les maladies cardiovasculaires, le diabète, la dégénérescence maculaire liée à l'âge, l'infertilité, l'ostéoporose, la sclérose en plaques, la maladie de Niemann-Pick de type C, la maladie de Parkinson et les cancers^.5,6

Qui devrait lire ce document ?

La croissance récente des études basées sur les sciences omiques a créé des opportunités pour les chercheurs principaux et les directeurs de laboratoire d'explorer les avantages de l'exploitation des essais métabolomiques et des données phénotypiques. Les études métabolomiques devenant de plus en plus accessibles à un plus grand nombre d'objectifs d'étude, ce guide devrait être utile à tous ceux qui travaillent dans le domaine des sciences de la vie, qu'il s'agisse de chercheurs chevronnés en métabolomique, de généticiens, de pharmacologues ou de chercheurs en cancérologie. L'importance croissante de la métabolomique pour la recherche indépendante et les résultats multi-omiques fait qu'une compréhension fondamentale de la manière de développer une étude métabolomique réussie est importante pour tous les scientifiques analytiques.

Qu'allez-vous apprendre ?

Your Guide to a Successful Metabolomic Study permettra aux chercheurs d'exploiter la métabolomique dans leurs laboratoires et leurs flux de travail pour une variété d'indications dans l'ensemble des sciences de la vie. Nous aborderons notamment la sélection des métabolites, l'analyse ciblée ou non, la technologie et l'instrumentation appropriées, la conception de l'étude, l'analyse du contrôle ou des variantes, les types d'échantillons, la préparation des échantillons et l'analyse efficace des résultats de la métabolomique.

Les chapitres en un coup d'œil

1. Les 8 questions les plus importantes à poser à votre fournisseur de métabolomique : Les questions les plus importantes à poser pour trouver le bon fournisseur et mener à bien votre étude métabolomique en toute confiance.
2. Processus d'étude métabolomique : Une discussion sur les considérations clés pour la conception de l'étude, la préparation des échantillons, l'analyse et l'interprétation des données.
3. Construire votre étude métabolomique : Une plongée profonde dans la conception de votre étude - y compris la définition de vos objectifs, de la puissance de l'étude, des contrôles et de la taille de l'étude - pour s'assurer que votre protocole fournit des résultats de haute qualité permettant de tirer des enseignements exploitables.
4. Types d'échantillons pour la métabolomique : Un examen plus approfondi des types d'échantillons les plus courants utilisés dans les études métabolomiques et des considérations relatives à la collecte, au transport et au stockage, ainsi que des meilleures pratiques pour chacun d'entre eux.
5. Préparation, stockage et transport des échantillons de métabolomique : Meilleures pratiques pour la collecte, l'expédition et la préparation des échantillons afin de préserver leur intégrité et de réduire le risque de variabilité des données, d'interférence avec les instruments et de dégradation des métabolites.
6. Analyse, interprétation et perspectives de l'étude métabolomique : Un examen approfondi des outils d'analyse et d'interprétation des données et de l'assistance à laquelle vous aurez accès lorsque vous réaliserez votre étude métabolomique avec Metabolon.
7. La fin de ce guide, le début de vos propres études métabolomiques : Voici une revue rapide des principaux points abordés dans chaque chapitre, qui vous permettra de trouver rapidement ce dont vous avez besoin.

Implications des métabolites pour la recherche

Compte tenu de l'efficacité de la métabolomique dans la recherche sur les états pathologiques, les entreprises utilisent de plus en plus d'outils métaboliques dans leurs études. Metabolon propose plusieurs méthodologies pour soutenir l'analyse métabolomique dans les efforts de recherche dans l'ensemble des sciences de la vie, y compris des panels et des essais ciblés qui couvrent plus de 1 000 métabolites et lipides dans un large éventail de classes biochimiques, de voies métaboliques et de processus physiologiques, et qui peuvent être personnalisés pour s'adapter au mieux à n'importe quelle application.

Vous êtes prêt à découvrir les nouvelles connaissances que la métabolomique peut apporter à votre recherche ? Contactez-nous dès aujourd'hui pour en savoir plus.

Références

1. Surendran P, Stewart ID, Au Yeung VPW, et al. Rare and common genetic determinants of metabolic individuality and their effects on human health. Nat Med 28, 2321-2332 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-02046-0
2. Lotta LA, Pietzner M, Stewart ID, et al. Une approche multiplateforme identifie les régulateurs génétiques du métabolisme humain et de la santé. Nat Genet 53, 54-64 (2021). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00751-5
3. Biringer RG. Le rôle des eicosanoïdes dans la maladie d'Alzheimer. Int J Environ Res Public Health. 2019 Jul 18;16(14):2560. doi : 10.3390/ijerph16142560. PMID : 31323750 ; PMCID : PMC6678666.
4. Solito E, Sastre M. Microglia function in Alzheimer's disease. Front. Pharmacol. 2012;3 doi : 10.3389/fphar.2012.00014.
5. Samadi A, Sabuncuoglu S, Samadi M, Isikhan SY, Chirumbolo S, Peana M, Lay I, Yalcinkaya A, Bjørklund G. A Comprehensive Review on Oxysterols and Related Diseases. Curr Med Chem. 2021 ; 28(1) : 110-136. doi : 10.2174/0929867327666200316142659.
6. de Freitas FA, Levy D, Reichert CO, Cunha-Neto E, Kalil J, Bydlowski SP. Effets des oxystérols sur les cellules immunitaires et les maladies associées. Cells. 2022 ; 11(8) : 1251. https://doi.org/10.3390/cells11081251