Por qué Metabolon
El uso por parte de Metabolonde tecnologías avanzadas de inteligencia artificial y aprendizaje automático automatiza las tareas rutinarias para que nuestros expertos internos puedan centrar sus esfuerzos en los retos científicos que más requieren su experiencia.
Hemos dedicado los últimos 20 años a crear la mejor competencia en metabolómica del mundo. En la actualidad, facilitamos, aceleramos y apoyamos el desarrollo de fármacos mediante el descubrimiento de biomarcadores, la comprensión de los mecanismos de acción, la estratificación de pacientes y mucho más.
Metabolon measures biochemical changes through the study of small molecules to provide a profound understanding of biological systems. Data science enables the continuous improvement of our industry-leading capabilities, allowing us to provide a broader view beyond any other metabolomic provider.
Como parte de nuestras iniciativas de ciencia de datos, aprovechamos la inteligencia artificial y las tecnologías de aprendizaje automático para extraer información y reconocer patrones de datos computacionalmente. La capacidad de aprendizaje automático de Metabolonmejora el rendimiento de nuestra curación de datos, identifica firmas bioquímicas y detecta anomalías para garantizar un control de calidad preciso y rápido. Nuestra ciencia de datos y capacidades de aprendizaje automático proporcionan una mejor cobertura, calidad, tiempo de entrega, interpretaciones y, en última instancia, el éxito del estudio para nuestros clientes.
La eficacia del aprendizaje automático está estrechamente relacionada con la precisión, la amplitud y la coherencia de los datos con los que se entrena. Mucho antes del auge de la ciencia de datos, los profesionales Metabolon generaban conjuntos de datos curados por expertos, análisis estadísticos precisos e informes con profundos conocimientos biológicos.
In the lab, time is always of the essence, and attention to detail is paramount. Late-stage analysis revealing flaws in original data can invalidate days or weeks of work, de-railing timelines and production deliverables. Machine learning technologies enable us to provide clients with a compressed quality control cycle to detect failure modes much earlier than is possible with a purely manual process.
For example, with several product lines, stringent requirements are tested via statistical analysis once curation is complete. A fully manual process would require several days of work. The auto curation utility, combined with automated statistical analyses targeted at product requirements, has enabled the classification of those samples that would likely fail quality control checks days later. Back-up samples may then be immediately run, decreasing turnaround time for the client and reducing the amount of labor spent on samples doomed to fail at a downstream quality control step.
Metabolon ha demostrado la utilidad de los enfoques de aprendizaje automático que proporcionan resultados que se aproximan al posprocesamiento dirigido por expertos. La detección instantánea de los modos de fallo tras la producción inicial de datos en bruto y la revisión humana específica se traducen en un ahorro de tiempo significativo, una entrega media de productos más rápida y una reducción de la mano de obra, que puede centrarse en resultados de alta calidad en lugar de en repeticiones.
En los libros de texto sobre aprendizaje automático, los problemas de etiquetado se resuelven aprendiendo un modelo de clasificación a partir de datos reales insesgados. En las aplicaciones reales, sin embargo, la cuestión puede complicarse significativamente por las prácticas y protocolos utilizados para producir los datos de entrenamiento. Por ejemplo, Metabolon genera datos de espectroscopia de masas LC/MS a partir de los cuales se infiere la presencia de metabolitos. Históricamente, los conservadores expertos examinaban diligentemente estos datos con ayuda del software para confirmar o negar la presencia de los compuestos. En cada muestra procesada en nuestras plataformas se examina la presencia o ausencia de cada uno de los más de 5400 compuestos de la biblioteca de metabolitos de referencia de Metabolon.
El aprendizaje automático nos permite conseguir estos mismos datos de alta calidad, pero mucho más rápido. Podemos llevar un conjunto de datos directamente al control de calidad mediante el aprendizaje automático, ahorrando tiempo al realizar la curación inicial de forma automática. El aprendizaje automático también nos permite determinar con rapidez y certeza qué compuestos están presentes y cuáles no lo estuvieron nunca, reduciendo significativamente o incluso eliminando la necesidad de que expertos humanos tomen estas decisiones.
Basado en datos históricos, el aprendizaje automático alimenta una utilidad de autocurado que puede curar muchos compuestos rutinarios. Consideremos el colesterol, que se encuentra fácilmente en el plasma humano y, por tanto, no es un uso eficiente de la experiencia del personal para identificar positivamente este compuesto. Con la ayuda de las herramientas de aprendizaje automático, podemos aprovechar las habilidades de nuestros expertos humanos para detectar la presencia de sulfato de etilparabeno, que a menudo se presenta con iones interferentes, o diferenciar entre compuestos como la isoleucilglicina y la alanilvalina. Estos compuestos no se separan cromatográficamente, pero presentan una fragmentación MS/MS distinta, que suele contener una enorme variedad de información.
We’re proud of our metabolite knowledgebase and industry-leading expertise, but we’re not stopping there. There is still much to be discovered in terms of new compounds and their impact on life sciences research and drug development.
We’re committed to unlocking that knowledge to deliver game-changing insights. The body of literature, reports, and insights produced by Metabolon’s scientists have served as the basis for a collaboration with data science to develop a shared vocabulary, a knowledgebase, and software to support the recording of continued knowledge expansion. A
rtificial intelligence and machine learning technologies enable our experts to leverage our vast internal experience of highly curated pathway knowledge, disease profiles, and the world’s best metabolomic insights. Future data science collaborations with these experts will automatically surface relevant historical knowledge to expert staff on each experiment run with Metabolon.
La inteligencia artificial y las tecnologías de aprendizaje automático son ingredientes cruciales para el éxito de nuestros clientes. Cada día ponemos estas tecnologías al servicio de nuestros clientes para obtener información práctica e introducir nuevas terapias con mayor rapidez.
"En Metabolon, la inteligencia artificial y el aprendizaje automático son ingredientes cruciales para el éxito de nuestros clientes. Nuestros enfoques de aprendizaje automático se han traducido en un enorme ahorro de tiempo, una entrega media de productos más rápida y una mayor precisión para nuestros clientes."
William LeFew, Ph.D.
Director, Data Science
Una vez que se comprende todo el valor de la metabolómica, la única pregunta que queda es: ¿quién lo hace mejor? Aunque muchos laboratorios cuentan con capacidades para la elaboración de perfiles de metabolitos o de química analítica, las tecnologías de metabolómica integrales son extremadamente escasas.
La identificación precisa e imparcial de los metabolitos en todo el metaboloma plantea retos en cuanto a la relación señal-ruido que muy pocos laboratorios están preparados para afrontar. Además, convertir cantidades ingentes de datos en información útil resulta lento, cuando no imposible, para la mayoría, ya que una interpretación adecuada requiere dos elementos de los que se carece: experiencia y una base de datos exhaustiva.
Gracias a nuestra sólida plataforma y a nuestras herramientas de visualización, nuestros expertos son los únicos capaces de ofrecerle más información sobre su molécula y desarrollar paneles de ensayos que le ayuden a concentrarse en los resultados que necesita.
Cobertura
Capacidad para interrogar a miles de metabolitos a través de diversos espacios bioquímicos, revelando nuevos conocimientos y oportunidades.
Comparabilidad
Capacidad para integrar los datos de diferentes estudios en el mismo conjunto de datos, en diferentes geografías, entre diferentes pacientes a lo largo del tiempo.
Competencia
Capacidad para informar sobre el diseño adecuado de los estudios, generar datos de alta calidad, obtener conocimientos biológicos y formular recomendaciones prácticas.
Capacidad
Capacidad para procesar cientos de miles de muestras de forma rápida y rentable para dar servicio a una demanda en rápido crecimiento.
Solicite un presupuesto para nuestros servicios, obtenga más información sobre tipos de muestras y procedimientos de manipulación, solicite una carta de apoyo o envíe una pregunta sobre cómo la metabolómica puede hacer avanzar su investigación.
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