Votre guide de la métabolomique

Conception de l'étude Série de succès

Avant de vous lancer dans une étude métabolomique, vous devez prendre en compte plusieurs éléments importants, en particulier si vous comptez travailler avec un fournisseur pour mener à bien votre étude. Dans cette série, nous vous présentons tout ce que vous devez savoir pour garantir le succès de votre étude métabolomique, y compris ce à quoi vous pouvez vous attendre en travaillant avec Metabolon, à chaque étape du processus, de la conception de votre étude à l'interprétation de vos données.

Guide des chapitres

Chapitre 0 - Votre guide pour une étude métabolomique réussie

Your Guide to a Successful Metabolomic Study permettra aux chercheurs d'exploiter la métabolomique dans leurs laboratoires et leurs flux de travail pour une variété d'indications dans l'ensemble des sciences de la vie. Nous aborderons notamment la sélection des métabolites, l'analyse ciblée ou non, la technologie et l'instrumentation appropriées, la conception de l'étude, l'analyse du contrôle ou des variantes, les types d'échantillons, la préparation des échantillons et l'analyse efficace des résultats de la métabolomique.

Chapitre 1 - Les 8 questions les plus importantes à poser à votre fournisseur de services métabolomiques

Avant de vous lancer dans une étude métabolomique, vous devez tenir compte de plusieurs éléments importants, en particulier si vous comptez travailler avec un fournisseur pour mener à bien votre étude. Nous vous présentons ici les questions les plus importantes que vous devez poser pour trouver le bon fournisseur et réaliser votre étude métabolomique en toute confiance.

Chapitre 2 - Déroulement de l'étude métabolomique

Maintenant que nous avons passé en revue certaines des considérations les plus importantes à prendre en compte lorsque vous décidez avec qui travailler pour vos études métabolomiques (si vous ne réalisez pas vos études en interne), il est temps de plonger dans le flux de travail de l'étude métabolomique. Dans ce chapitre, nous présentons une vue d'ensemble de chaque étape du flux de travail, de la conception de l'étude à l'analyse et à l'interprétation des données, et nous expliquons comment Metabolon peut vous aider à chaque étape du processus.

Chapitre 3 - Construire votre étude métabolomique

Comme nous l'avons vu dans le chapitre précédent de ce guide, la réussite d'une analyse et d'une interprétation métabolomique commence par une étude bien conçue. Un certain nombre de facteurs doivent être pris en compte lors de la conception de l'étude afin de s'assurer que le protocole fournit des résultats de haute qualité permettant d'obtenir des informations exploitables. Dans ce chapitre, nous allons passer en revue chacun de ces facteurs, en décomposant le processus en étapes simples et en donnant des conseils clairs et faciles à suivre.

Chapitre 4 - Types d'échantillons pour la métabolomique

Dans ce chapitre, nous examinerons de plus près les types d'échantillons les plus courants utilisés dans les études métabolomiques. La plupart des échantillons étudiés sont d'origine humaine ou animale, mais il peut également s'agir d'échantillons environnementaux, tels que le sol et l'eau.

Chapitre 5 - Préparation, stockage et transport des échantillons de métabolomique

Quel que soit le type d'échantillon, des procédures solides de collecte et de transport des échantillons doivent être mises en place pour préserver l'intégrité des échantillons. Dans le cas contraire, le risque de variabilité des données, d'interférences avec les instruments et de dégradation des métabolites est accru. Dans ce chapitre, nous présentons une vue d'ensemble des étapes courantes qui sous-tendent la préparation, le stockage et le transport des échantillons.

Chapitre 6 - Analyse, interprétation et perspectives de l'étude métabolomique

Vient ensuite le moment excitant où vos données vous sont renvoyées ! Alors que vous vous plongez dans les chiffres, les scientifiques de Metabolon vous aideront à transformer vos résultats en une histoire. Dans ce chapitre, nous passerons en revue les résultats de l'analyse, de l'interprétation et de la compréhension de votre étude.

Chapitre 7 - La fin de ce guide, le début de vos propres études métabolomiques

Vous êtes maintenant équipé pour construire un flux de travail expérimental en métabolomique ; nous vous encourageons à vous référer aux chapitres précédents de ce guide à tout moment et à nous contacter pour de plus amples informations. Nous vous invitons à vous référer aux chapitres précédents de ce guide à tout moment et à nous contacter pour de plus amples informations. Voici une revue rapide des principaux points abordés dans chaque chapitre qui vous permettra de trouver rapidement ce dont vous avez besoin.

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a compris toute la valeur de la métabolomique, il ne reste plus qu'à savoir qui la pratique le mieux. Si de nombreux laboratoires disposent de capacités de profilage des métabolites ou de chimie analytique, les technologies métabolomiques complètes sont extrêmement rares. L'identification précise et non biaisée des métabolites dans l'ensemble du métabolome pose des problèmes de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de résoudre. En outre, la traduction de quantités massives de données en informations exploitables est lente, voire impossible, pour la plupart des laboratoires, car une interprétation correcte nécessite deux choses qui sont rares : l'expérience et une base de données complète.

Seul Metabolon possède les quatre capacités métabolomiques de base.

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Couverture

Capacité d'interroger des milliers de métabolites dans divers espaces biochimiques, révélant de nouvelles perspectives et opportunités.

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Comparabilité

Capacité à intégrer les données de différentes études dans le même ensemble de données, dans différentes zones géographiques et chez différents patients au fil du temps.

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Compétence

Capacité à informer sur la conception d'une étude appropriée, à générer des données de haute qualité, à obtenir des informations biologiques et à formuler des recommandations exploitables.

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Capacité

Capacité à traiter des centaines de milliers d'échantillons rapidement et à moindre coût pour répondre à une demande en forte croissance

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

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Une bibliothèque de plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 dans le plasma humain, tous référencés dans le contexte des voies biochimiques.

  • C'est 5 fois plus que les métabolites du concurrent le plus proche.
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Une expérience inégalée en matière d'analyse et d'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats significatifs.

  • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
  • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
  • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

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Références

1. Zgoda-Pols, J.R., et al., Une analyse métabolomique révèle une élévation du sulfate de 3-indoxyle dans le plasma et le cerveau lors d'une lésion rénale aiguë d'origine chimique chez la souris : étude des agonistes des récepteurs de l'acide nicotinique. Toxicol Appl Pharmacol, 2011. 255(1) : p. 48-56.

2. Bryant, J.A., et al., L'impact d'un traitement oral à base de microbiome purifié sur le microbiome gastro-intestinal. Nat Med, 2026. 32(1) : p. 186-196

3. McGovern, B. H., et al., « SER-109, un médicament expérimental ciblant le microbiome visant à réduire les récidives après une infection à Clostridioides difficile : enseignements tirés d'un essai de phase II ». Clin Infect Dis, 2021, 72(12), p. 2132-2140.

4. Feuerstadt, P., et al., SER-109, un traitement oral à base de microbiome contre les infections récurrentes à Clostridioides difficile. N Engl J Med, 2022. 386(3) : p. 220-229.

5. Hu, Z., et al., La métabolomique ciblée met en évidence de nouveaux biomarqueurs diagnostiques du cancer colorectal. Mol Oncol, 2025. 19(6) : p. 1737-1750.

6. Butler, F.M., et al., Les habitudes alimentaires végétariennes et les métabolites liés à l'alimentation sont associés à la fonction rénale dans la cohorte de l'étude Adventist Health Study-2. J Ren Nutr, 2025.

7. Stanford, J., et al., « Profilage métabolomique et évaluation de la qualité de l'alimentation dans le cadre d'un essai croisé randomisé portant sur des régimes alimentaires sains et courants ». Mol Nutr Food Res, 2025. 69(23) : p. e70271.

8. O’Connor, L.E., et al., Profilage métabolomique d’un régime alimentaire ultra-transformé dans le cadre d’un essai alimentaire croisé randomisé et contrôlé mené à domicile. J Nutr, 2023. 153(8) : p. 2181-2192.

9. Fritsch, D.A., et al., La fonction du microbiome est à la base de l'efficacité d'une intervention alimentaire enrichie en fibres chez les chiens souffrant de diarrhée chronique du gros intestin. BMC Vet Res, 2022. 18(1) : p. 245.

10. Leal, L.N., et al., « Un apport nutritionnel adéquat avant le sevrage améliore la productivité laitière et réduit le risque d'abattage chez les vaches Holstein ». J Dairy Sci, 2025. 108(6) : p. 5875-5888.

11. Ahsin, M., et al., La santé des sols et des pâturages est à l'origine de l'amélioration de la densité nutritionnelle de la viande bovine, telle que déterminée par la métabolomique non ciblée dans les systèmes d'élevage bovin nourri à l'herbe du sud des États-Unis. NPJ Sci Food, 2025. 9(1) : p. 151.

12. Yin, W., et al., Profil lipidique plasmatique chez différentes espèces pour l'identification de modèles animaux optimaux de la dyslipidémie humaine. J Lipid Res, 2012. 53(1) : p. 51-65.

13. Porter, F. D., et al., Les produits d'oxydation du cholestérol constituent des biomarqueurs sanguins sensibles et spécifiques de la maladie de Niemann-Pick de type C1. Sci Transl Med, 2010. 2(56) : p. 56ra81.

14. Needham, B. D., et al., Profils des métabolites plasmatiques et fécaux dans les troubles du spectre autistique. Biol Psychiatry, 2021. 89(5) : p. 451-462

15. Li, C., et al., L'estradiol et mTORC2 agissent en synergie pour favoriser la biosynthèse des prostaglandines et la tumorigenèse dans les cellules LAM déficientes en TSC2. J Exp Med, 2014. 211(1) : p. 15-28.

16. Green, P.G., et al., Flexibilité métabolique et remodelage inverse du cœur défaillant chez l'homme. Eur Heart J, 2025. 46(25) : p. 2422-2433.

17. Maekawa, H., et al., L'inhibition du SGLT2 protège la fonction rénale grâce à une répression épigénétique, dépendante de la SAM, des gènes inflammatoires en cas de stress métabolique. J Clin Invest, 2025. 135(19).

18. Wu, D., et al., Des criblages intégrés révèlent que la déplétion en nucléotides guaniniques, rendue irréversible par le ciblage de l'IMPDH2, inhibe le cancer du pancréas et potentialise l'inhibition de KRAS. Gut, 2026.

19. Schwerdtfeger, L.A., et al., Le microbiote intestinal et ses métabolites sont associés à la progression de la sclérose en plaques. Cell Rep Med, 2025. 6(4) : p. 102055.

20. Wu, H., et al., Dynamique du microbiome et du métabolome associée à un mauvais contrôle glycémique et aux réactions aux changements de mode de vie. Nat Med, 2025. 31(7) : p. 2222-2231.

21. Jacobs, J.P., et al., La thérapie cognitivo-comportementale pour le syndrome du côlon irritable entraîne des modifications bidirectionnelles de l'axe cerveau-intestin-microbiome associées à une amélioration des symptômes gastro-intestinaux. Microbiome, 2021. 9(1) : p. 236.

22. Pietzner, M., et al., « Les métabolites plasmatiques pour cartographier les voies métaboliques dans la multimorbidité liée aux maladies non transmissibles ». Nat Med, 2021. 27(3) : p. 471-479.

23. Faquih, T.O., et al., « Prédiction métabolomique robuste de l'âge à partir d'un large éventail de métabolites ». J Gerontol A Biol Sci Med Sci, 2025, vol. 80, n° 3.

24. Scherer, N., et al., « L'association de la métabolomique et du séquençage de l'exome met en évidence des effets graduels de variants hétérozygotes rares et délétères sur la fonction des gènes et les traits humains ». Nat Genet, 2025. 57(1) : p. 193-205.

25. Holmes, Z.C., et al., Une analyse métabolomique non ciblée du lait maternel provenant de mères en bonne santé met en évidence les facteurs à l'origine de la variabilité des métabolites. Sci Rep, 2024. 14(1) : p. 20827.

26. Titz, B., et al., Implications des facteurs de confusion oculaires pour les analyses protéomiques et métabolomiques de l'humeur aqueuse dans les maladies rétiniennes. Transl Vis Sci Technol, 2024. 13(6) : p. 17.

27. Bloom, S.M., et al., La dépendance en cystéine de Lactobacillus iners constitue une cible thérapeutique potentielle pour la modulation du microbiote vaginal. Nat Microbiol, 2022. 7(3) : p. 434-450.

28. Leimer, E.M., et al., Profil lipidique du liquide synovial humain à la suite d'une fracture intra-articulaire de la cheville. J Orthop Res, 2017. 35(3) : p. 657-666.