Recogida de muestras | OMNImet™-GUT

OMNImet™-GUT de DNA Genotek, validado por Metabolon

OMNImet-GUT (ME-200) es un sistema todo en uno para la recogida, homogeneización y estabilización a temperatura ambiente de metabolitos específicos y no específicos de muestras fecales.

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Preparación, almacenamiento y transporte de muestras de metabolómica

Muestreo para metabolómica fecal

Las muestras fecales presentan desafíos prácticos únicos, que requieren una manipulación especial durante la recogida de muestras. Para lograr una estabilización completa y mitigar los problemas de submuestreo, las muestras deben homogeneizarse en el punto de recogida. Hemos colaborado con DNA Genotek para ofrecer el primer y único dispositivo diseñado para el almacenamiento a temperatura ambiente y la estabilización de muestras fecales humanas para el análisis metabolómico. Para obtener un proceso completo de nuestro proceso validado, descargue nuestro artículo técnico.

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Recogida a domicilio más fácil

Hemos colaborado con DNA Genotek para ofrecer el primer y único dispositivo diseñado para el almacenamiento a temperatura ambiente y la estabilización de muestras fecales humanas para el análisis metabolómico.

R Recogida fácil, privada y cómoda

Mejore la experiencia del paciente y el cumplimiento con la auto-recolección de muestras de alta calidad, sin necesidad de visita clínica o congelación de muestras en casa.

R Almacenar y transportar sin congelar

La solución de estabilización patentada por DNA Genotek protege la integridad de la muestra a temperatura ambiente durante un máximo de cuatro días, eliminando el engorroso y costoso almacenamiento en cadena de frío y el envío.

R Validado para la metabolómica global de Metabolony el panel específico de ácidos grasos de cadena corta

Nuestros estudios de validación han demostrado que OMNImet-GUT protege y conserva el perfil metabolómico de las muestras recogidas hasta cuatro días a temperatura ambiente para el MetabolonGlobal Discovery Panelque utiliza metabolómica no dirigida, mientras que los perfiles de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) se mantienen hasta siete días a temperatura ambiente para nuestro Panel Dirigido de Ácidos Grasos de Cadena Corta.

R Admite un enfoque multiómico

OMNImet-GUT tiene la misma experiencia de usuario que otros dispositivos de DNA Genotek. Esto proporciona un método familiar y probado de recogida en casa para implementar de forma fiable un enfoque multiómico en su investigación.

R ÉxitoMetabolon estudioMetabolon

Los tubos OMNImet-GUT llevan un código de barras para la trazabilidad de las muestras y la compatibilidad con el kit de manipulación de muestras Study Success de Metabolon. Se admiten como opción preferida de Metabolon para muestras fecales humanas a fin de lograr los resultados más rápidos y fiables.

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LIBRO BLANCO: Proceso de validación de OMNImet-GUT

Cobertura de metabolitos en muestras recogidas con tubos OMNImet-GUT (ME-200)

La congelación rápida a -80 °C es el estándar de oro de la recogida de muestras fecales, por lo que la cobertura de metabolitos por el Global Discovery Panel deMetabolonen muestras OMNImet-GUT se comparó con este punto de referencia. El número de metabolitos detectados fue similar entre los dos métodos de recogida(Figura 1), lo que demuestra que OMNImet-GUT no introduce sesgos sistemáticos o artefactos experimentales y mantiene un nivel de sensibilidad de detección estándar de oro para el análisis metabolómico.

Figura 1. Preservación de la cobertura metabolómica. Se recogieron muestras de réplicas técnicas (n = 3) de cada uno de los 7 donantes en un dispositivo de congelación rápida o en un dispositivo OMNImet-GUT (ME-200), seguido de congelación inmediata a -80°C. Se representa el número de metabolitos detectados en todas las réplicas técnicas (n = 3) de las muestras de cada donante.

Figura 2. Medición precisa de metabolitos individuales y rutas metabólicas. Análisis de correlación a través de n = 7 réplicas biológicas (después de promediar n = 3 réplicas técnicas de cada donante) en cada condición de almacenamiento OMNImet-GUT (línea de base (T0), temperatura ambiente durante 1, 4 o 7 días (T1, T4, T7), o congelación-descongelación) frente a congelación rápida (FF). La mediana del coeficiente de Spearman en cada clase principal de sustancias bioquímicas (supervías metabólicas) se representa gráficamente y el número de sustancias bioquímicas en cada supervía (detectadas en muestras ultracongeladas) está etiquetado.

Estabilidad de la metabolómica con tubos OMNImet-GUT (ME-200)

Para medir la estabilidad, los metabolitos se midieron a los 0, 1, 4 y 7 días a temperatura ambiente y se compararon con muestras congeladas rápidamente (correlación de Spearman). Los metabolitos se agruparon por supervías y se analizaron los coeficientes de Spearman. La figura 2 muestra que el almacenamiento en OMNImet-GUT conserva la mayoría de los metabolitos con alta fidelidad durante un máximo de 7 días.

Validado para el Global Discovery Panel, el Bile Acids Targeted Panel y el Short Chain Fatty Acids Targeted Panel de Metabolon.

Los ácidos grasos de cadena corta (AGCC) son mediadores clave de la actividad microbiana intestinal y desempeñan un papel importante en la regulación del sistema inmunitario, el mantenimiento de la barrera epitelial intestinal y la prevención de trastornos como el síndrome metabólico, la enfermedad inflamatoria intestinal y determinados tipos de cáncer^.1 Para analizar los AGCC utilizando OMNImet-GUT, se almacenaron muestras fecales de 7 donantes a temperatura ambiente durante periodos de tiempo variables en OMNImet-GUT. Las concentraciones de AGCC en las muestras crudas a temperatura ambiente cambiaron drásticamente al cabo de 4 días, mientras que en las muestras OMNImet-GUT no se produjeron cambios (Figura 3). Los AGCC permanecen estables en OMNImet-GUT a temperatura ambiente durante al menos 7 días. Estos resultados demuestran que la recogida y almacenamiento de muestras en OMNImet-GUT permite la medición precisa de>800 metabolitospor muestra mediante el Global Discovery Panel deMetabolon, así como el análisis cuantitativo de ochoSCFAs.

Estabilidad de la metabolómica con tubos OMNImet™-GUT (ME-200)

Figura 3. Estabilidad de SCFAs en OMNImet-GUT Estabilidad de los AGCC en OMNImet-GUT. Alícuotas de una muestra fecal cruda de 7 donantes se dejaron sin estabilizar (n = 4 réplicas) o se almacenaron en OMNImet-GUT (ME-200) (n = 4 réplicas, A/B/C/D) a temperatura ambiente durante el número de días indicado (T0 a T13), seguido de la cuantificación de ocho AGCC mediante LC-MS/MS dirigida.

Referencias

1. Scrimps-Rutledge, A.C., Condreanu, S.G., Sherrod, S.D., y McLean, J.A. (2016).Untargeted Metabolomics Strategies-Challenges and Emerging Directions.J Am Soc Mass Spectrom 27, 1897-1905. http://doi.org/10.1007/s13361-016-1469-7

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Referencias

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