Recogida de muestras | OMNImet™-GUT
OMNImet™-GUT de DNA Genotek, validado por Metabolon
OMNImet-GUT (ME-200) es un sistema todo en uno para la recogida, homogeneización y estabilización a temperatura ambiente de metabolitos específicos y no específicos de muestras fecales.
Muestreo para metabolómica fecal
Las muestras fecales presentan desafíos prácticos únicos, que requieren una manipulación especial durante la recogida de muestras. Para lograr una estabilización completa y mitigar los problemas de submuestreo, las muestras deben homogeneizarse en el punto de recogida. Hemos colaborado con DNA Genotek para ofrecer el primer y único dispositivo diseñado para el almacenamiento a temperatura ambiente y la estabilización de muestras fecales humanas para el análisis metabolómico. Para obtener un proceso completo de nuestro proceso validado, descargue nuestro artículo técnico.
Recogida a domicilio más fácil
Hemos colaborado con DNA Genotek para ofrecer el primer y único dispositivo diseñado para el almacenamiento a temperatura ambiente y la estabilización de muestras fecales humanas para el análisis metabolómico.
Recogida fácil, privada y cómoda
Mejore la experiencia del paciente y el cumplimiento con la auto-recolección de muestras de alta calidad, sin necesidad de visita clínica o congelación de muestras en casa.
Almacenar y transportar sin congelar
La solución de estabilización patentada por DNA Genotek protege la integridad de la muestra a temperatura ambiente durante un máximo de cuatro días, eliminando el engorroso y costoso almacenamiento en cadena de frío y el envío.
Validado para la metabolómica global de Metabolony el panel específico de ácidos grasos de cadena corta
Nuestros estudios de validación han demostrado que OMNImet-GUT protege y conserva el perfil metabolómico de las muestras recogidas hasta cuatro días a temperatura ambiente para el MetabolonGlobal Discovery Panelque utiliza metabolómica no dirigida, mientras que los perfiles de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) se mantienen hasta siete días a temperatura ambiente para nuestro Panel Dirigido de Ácidos Grasos de Cadena Corta.
Admite un enfoque multiómico
OMNImet-GUT tiene la misma experiencia de usuario que otros dispositivos de DNA Genotek. Esto proporciona un método familiar y probado de recogida en casa para implementar de forma fiable un enfoque multiómico en su investigación.
ÉxitoMetabolon estudioMetabolon
Los tubos OMNImet-GUT llevan un código de barras para la trazabilidad de las muestras y la compatibilidad con el kit de manipulación de muestras Study Success de Metabolon. Se admiten como opción preferida de Metabolon para muestras fecales humanas a fin de lograr los resultados más rápidos y fiables.
Cobertura de metabolitos en muestras recogidas con tubos OMNImet-GUT (ME-200)
La congelación rápida a -80 °C es el estándar de oro de la recogida de muestras fecales, por lo que la cobertura de metabolitos por el Global Discovery Panel deMetabolonen muestras OMNImet-GUT se comparó con este punto de referencia. El número de metabolitos detectados fue similar entre los dos métodos de recogida(Figura 1), lo que demuestra que OMNImet-GUT no introduce sesgos sistemáticos o artefactos experimentales y mantiene un nivel de sensibilidad de detección estándar de oro para el análisis metabolómico.
Figura 1. Preservación de la cobertura metabolómica. Se recogieron muestras de réplicas técnicas (n = 3) de cada uno de los 7 donantes en un dispositivo de congelación rápida o en un dispositivo OMNImet-GUT (ME-200), seguido de congelación inmediata a -80°C. Se representa el número de metabolitos detectados en todas las réplicas técnicas (n = 3) de las muestras de cada donante.
Figura 2. Medición precisa de metabolitos individuales y rutas metabólicas. Análisis de correlación a través de n = 7 réplicas biológicas (después de promediar n = 3 réplicas técnicas de cada donante) en cada condición de almacenamiento OMNImet-GUT (línea de base (T0), temperatura ambiente durante 1, 4 o 7 días (T1, T4, T7), o congelación-descongelación) frente a congelación rápida (FF). La mediana del coeficiente de Spearman en cada clase principal de sustancias bioquímicas (supervías metabólicas) se representa gráficamente y el número de sustancias bioquímicas en cada supervía (detectadas en muestras ultracongeladas) está etiquetado.
Estabilidad de la metabolómica con tubos OMNImet-GUT (ME-200)
Para medir la estabilidad, los metabolitos se midieron a los 0, 1, 4 y 7 días a temperatura ambiente y se compararon con muestras congeladas rápidamente (correlación de Spearman). Los metabolitos se agruparon por supervías y se analizaron los coeficientes de Spearman. La figura 2 muestra que el almacenamiento en OMNImet-GUT conserva la mayoría de los metabolitos con alta fidelidad durante un máximo de 7 días.
Validado para el Global Discovery Panel, el Bile Acids Targeted Panel y el Short Chain Fatty Acids Targeted Panel de Metabolon.
Los ácidos grasos de cadena corta (AGCC) son mediadores clave de la actividad microbiana intestinal y desempeñan un papel importante en la regulación del sistema inmunitario, el mantenimiento de la barrera epitelial intestinal y la prevención de trastornos como el síndrome metabólico, la enfermedad inflamatoria intestinal y determinados tipos de cáncer.1 Para analizar los AGCC utilizando OMNImet-GUT, se almacenaron muestras fecales de 7 donantes a temperatura ambiente durante periodos de tiempo variables en OMNImet-GUT. Las concentraciones de AGCC en las muestras crudas a temperatura ambiente cambiaron drásticamente al cabo de 4 días, mientras que en las muestras OMNImet-GUT no se produjeron cambios (Figura 3). Los AGCC permanecen estables en OMNImet-GUT a temperatura ambiente durante al menos 7 días. Estos resultados demuestran que la recogida y almacenamiento de muestras en OMNImet-GUT permite la medición precisa de>800 metabolitospor muestra mediante el Global Discovery Panel deMetabolon, así como el análisis cuantitativo de ochoSCFAs.
Figura 3. Estabilidad de SCFAs en OMNImet-GUT Estabilidad de los AGCC en OMNImet-GUT. Alícuotas de una muestra fecal cruda de 7 donantes se dejaron sin estabilizar (n = 4 réplicas) o se almacenaron en OMNImet-GUT (ME-200) (n = 4 réplicas, A/B/C/D) a temperatura ambiente durante el número de días indicado (T0 a T13), seguido de la cuantificación de ocho AGCC mediante LC-MS/MS dirigida.
Referencias
1. Scrimps-Rutledge, A.C., Condreanu, S.G., Sherrod, S.D., y McLean, J.A. (2016).Untargeted Metabolomics Strategies-Challenges and Emerging Directions.J Am Soc Mass Spectrom 27, 1897-1905. http://doi.org/10.1007/s13361-016-1469-7
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