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La métabolomique dans la recherche en génomique

La combinaison des technologies de la génomique et de la métabolomique offre une approche puissante pour comprendre les systèmes biologiques complexes et les mécanismes des maladies. La génomique fournit des informations sur les variations génétiques et les facteurs de risque potentiels de maladies, tandis que la métabolomique révèle les changements dynamiques dans les voies métaboliques et leurs produits. L'intégration de ces technologies permet aux chercheurs de relier les informations génétiques aux profils métaboliques, découvrant ainsi comment les variations génétiques influencent les processus métaboliques et contribuent à la maladie. Cette synergie améliore la capacité à identifier des biomarqueurs, à comprendre les mécanismes de la maladie et à développer des traitements personnalisés. En corrélant les données génomiques avec les niveaux de métabolites, les scientifiques peuvent obtenir une vision plus complète de la santé et de la maladie, ce qui permet d'améliorer les diagnostics et les stratégies thérapeutiques.

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La métabolomique dans la recherche protéomique

Contrairement aux protéines, qui se situent à une étape intermédiaire dans le dogme central de la biologie, les métabolites constituent généralement l'étape finale des processus biologiques, ce qui fait d'eux le reflet des apports combinés du génome, du protéome, du microbiome et de l'environnement. Ainsi, l'utilisation de la métabolomique pour évaluer le métabolome parallèlement au protéome est bénéfique pour de nombreux types d'études, y compris, mais sans s'y limiter, la caractérisation des mécanismes d'apparition et de progression des maladies, l'évaluation de la réponse thérapeutique et l'élucidation de diverses facettes de la biologie non-humaine.

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La métabolomique dans la recherche transcriptomique

La métabolomique peut considérablement améliorer la recherche transcriptomique en fournissant une vue dynamique des résultats fonctionnels de l'expression des gènes. Alors que la transcriptomique se concentre sur la quantification des transcrits d'ARN pour en déduire l'activité des gènes, la métabolomique examine les petites molécules produites au cours des processus métaboliques, qui sont des produits directs des fonctions cellulaires. En intégrant ces deux approches, les chercheurs peuvent corréler les changements dans l'expression des gènes avec les modifications des profils métaboliques, ce qui leur permet de mieux comprendre les réponses cellulaires et les mécanismes de régulation. Cette synergie permet d'identifier les voies métaboliques influencées par des expressions génétiques spécifiques, révélant ainsi des biomarqueurs et des cibles thérapeutiques potentiels.

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Métabolomique et microbiome

Le séquençage ciblé de l'ARNr 16S est généralement utilisé pour identifier les espèces et les souches bactériennes du microbiome intestinal. Cependant, cela ne révèle qu'une partie du tableau. En tant que moteurs clés du métabolisme, les métabolites reçoivent non seulement des données du génome, du protéome et de l'environnement, mais ils représentent également l'étape finale des processus biologiques, ce qui en fait le reflet le plus fidèle de l'état physiologique en temps réel d'un organisme. Compte tenu de cette interconnectivité, il est essentiel d'évaluer la métabolomique en même temps que d'autres données omiques pour acquérir une compréhension globale du microbiome intestinal et de ses effets sur la physiologie humaine.

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citations d'icônes

"Metabolon a développé une solution solide et évolutive au problème non trivial de l'interprétation biochimique de la métabolomique, spécifiquement adaptée à sa plateforme d'acquisition de données de premier plan. S'appuyant sur des décennies d'expérience en matière de curation de données, Metabolon fournit des outils de visualisation intuitifs pour l'analyse des voies et l'association des maladies, ce qui ajoute encore plus de valeur à un produit déjà exceptionnel."

David Broadhurst, PhD
Professeur de science des données sur les biosystèmes à l'université Edith Cowan, en Australie.

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