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Médecine de précision

La médecine de précision, rendue possible par la métabolomique

Traditionnellement, la plupart des interventions médicales suivent une approche unique, ont été conçues pour un patient "type" et ont été codifiées dans des directives de traitement. Ces stratégies peuvent s'avérer efficaces chez certaines personnes, alors que d'autres n'en tireront aucun bénéfice. En revanche, la médecine de précision prend en compte les différences entre les génomes, les environnements et les modes de vie des individus pour adapter la prévention et le traitement des maladies. Ainsi, la thérapie ciblée la plus appropriée est délivrée au bon patient au bon moment, ce qui est l'objectif de la médecine de précision. En outre, la capacité d'un patient à tolérer ou à répondre à une intervention thérapeutique (médicamenteuse et nutritionnelle) peut être caractérisée et les informations utilisées pour optimiser les effets de ces interventions. Malgré des progrès constants et de nombreuses réussites, notamment dans le domaine de l'oncologie, la médecine de précision n'a pas encore été mise en œuvre à grande échelle dans la pratique.

Les phénotypes des maladies humaines sont très complexes

Pour mettre en œuvre une approche fondée sur la médecine de précision, il faut être en mesure d'identifier les biomarqueurs associés à un phénotype de maladie spécifique. Le décryptage des génomes à l'origine des phénotypes est un moyen d'identifier les cibles des interventions. Cependant, l'existence d'un nombre impressionnant de variantes génétiques, la pénétration variable des variantes génétiques connues et les étiologies polygéniques rendent très difficile l'identification des anomalies génétiques pertinentes. Les influences extra-géniques (microbiome, épigénétique, environnement et facteurs liés au mode de vie) sur les phénotypes doivent également être prises en compte.

Existe-t-il un moyen relativement simple de déconvoluer des phénotypes complexes sous-tendus par de multiples facteurs ? La métabolomique pourrait être la réponse.

La métabolomique, un outil pour la médecine de précision

Le métabolome comprend l'ensemble des petites molécules (métabolites) présentes dans l'organisme. La métabolomique, technologie permettant d'étudier le métabolome, doit être considérée comme une méthode de phénotypage à haute résolution, car elle évalue les métabolites issus de tous les processus physiologiques, pathologiques/endogènes et exogènes qui se déroulent dans un organisme. Les métabolites varient entre la santé et la maladie et peuvent servir de biomarqueurs de la maladie et caractériser la réponse d'un patient au traitement.

Metabolon fournit des outils permettant d'étudier le métabolome de manière exhaustive et utilise une technologie métabolomique exclusive qui s'est avérée efficace pour détecter les erreurs innées du métabolisme et les maladies rares.

La métabolomique, source potentielle d'informations pour la médecine de précision

Les signatures métaboliques obtenues grâce à la métabolomique globale peuvent fournir des biomarqueurs prédictifs, pronostiques et diagnostiques, aider à disséquer les mécanismes moléculaires sous-jacents des maladies, étudier les liens entre le microbiote et l'organisme hôte, guider la classification des maladies et la stratification des patients, fournir des biomarqueurs de la réponse aux médicaments, de la sécurité et des interactions (pharmacométabolomique) dans les essais cliniques. On espère que la métabolomique aidera à définir un métabotype pour chaque génotype spécifique, offrant une lecture fonctionnelle pour les nombreux variants génétiques dont la signification est inconnue, et qu'elle fournira un moyen de surveiller le statut de rémission ou de rechute dans les maladies chroniques.

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Panneaux métabolomiques pour la médecine de précision

Panel ciblé d'acides aminés

Les acides aminés (AA) sont les éléments de base des peptides et des protéines. Ces petites molécules régulent les voies métaboliques impliquées dans l'entretien des cellules, la croissance, la reproduction et l'immunité. Les acides aminés ramifiés jouent un rôle important dans la construction des tissus musculaires et participent à l'augmentation de la synthèse des protéines. Les acides aminés jouent également un rôle dans la signalisation cellulaire, l'expression des gènes et la phosphorylation des protéines. Le maintien d'un équilibre optimal entre les acides aminés est essentiel au maintien d'un équilibre stable des processus physiologiques.
Panel ciblé d'acides aminés
Bêta-Hydroxybutyrate Essai d'une seule analyse

Bêta-Hydroxybutyrate Essai d'une seule analyse

Le β-hydroxybutyrate (BHB, 3-hydroxybutyrate) est un corps cétonique endogène qui s'accumule pendant les périodes de jeûne, de restriction calorique et d'exercice prolongé. Il est créé par un processus en plusieurs étapes impliquant la décomposition des acides gras en acétyl-CoA, la conversion en acétoacétate et la réduction en β-hydroxybutyrate dans le foie. Le BHB est la principale cétone présente dans le sang et est nécessaire au fonctionnement du cerveau, en particulier lorsque le glucose n'est pas disponible. Il présente également des avantages neuroprotecteurs, tels que le soulagement du stress oxydatif et l'inhibition de la voie apoptotique dans les cellules.

Panel ciblé sur les acides biliaires

Les acides biliaires sont dérivés du cholestérol et jouent un rôle important dans l'émulsification et la digestion des lipides. En outre, leur métabolisme est intimement lié au microbiote et il a été démontré qu'ils présentent une activité endocrinienne et métabolique via des récepteurs tels que FXR et TGR5. Le panel ciblé des acides biliaires mesure tous les principaux acides biliaires primaires et secondaires chez l'homme et le rongeur, ainsi que leurs conjugués de glycine et de taurine.
Panel ciblé sur les acides biliaires
C4 Single Analyte Assay (essai d'analyse unique)

C4 Single Analyte Assay (essai d'analyse unique)

La 7-α-hydroxy-4-cholestène-3-one (C4) est un intermédiaire dans la biosynthèse des acides biliaires à partir du cholestérol. Le précurseur du C4 est le 7α-hydroxycholestérol qui est produit à partir du cholestérol par l'enzyme hépatique, la 7α-hydroxylase. La 7-α-hydroxylase catalyse l'étape limitant la vitesse de la synthèse des acides biliaires et son activité est étroitement régulée par le récepteur FXR. La mesure du métabolite stable C4, produit de la réaction enzymatique oxydative suivant la 7-α-hydroxylase, reflète la synthèse hépatique des acides biliaires de-novo et l'activation du récepteur FXR. La malabsorption des acides biliaires est associée à diverses pathologies gastro-intestinales (par exemple, syndrome du côlon irritable, maladie iléale) et se caractérise par des taux sériques élevés de C4.

Panneau ciblé de Central Carbons

Le métabolisme central du carbone implique la conversion enzymatique des sucres en précurseurs métaboliques qui sont utilisés pour générer l'ensemble de la biomasse de la cellule. Les métabolites de ce groupe comprennent des composés clés du cycle de l'acide citrique qui relient les métabolismes des glucides, des lipides et des protéines. En plus de fournir des précurseurs métaboliques clés, le métabolisme central du carbone est utilisé pour oxyder les molécules de sucre simple obtenues à partir des aliments afin de fournir de l'énergie aux systèmes vivants. La mesure des métabolites du carbone central a une grande importance pour l'industrie car elle peut permettre l'ingénierie de certaines étapes métaboliques afin d'optimiser le flux de carbone vers les précurseurs de métabolites importants pour l'industrie.
Panneau ciblé de Central Carbons
Panel ciblé sur l'intolérance au glucose

Panel ciblé sur l'intolérance au glucose

L'intolérance au glucose est un état prédiabétique d'hyperglycémie associé à une résistance à l'insuline et à un risque accru de pathologie cardiovasculaire (Barr, 2007). Cet état survient lorsque la glycémie reste élevée pendant une période prolongée après l'ingestion orale de glucose, mais pas suffisamment pour être diagnostiquée comme un diabète de type 2.

L'altération de la tolérance au glucose peut être évaluée à l'aide d'une seule prise de sang à jeun en mesurant un panel de métabolites sélectionnés comprenant deux petits acides organiques (l'acide α-hydroxybutyrique (AHB) et l'acide 4-méthyl-2-oxopentanoïque (4MOP)), 2 lipides (acide oléique et linoléoyl glycérophosphocholine (LGPC)), un corps cétonique (acide β-hydroxybutyrique (BHBA)), un acide aminé (sérine), une vitamine (acide pantothénique (vitamine B5)) et du glucose.

Panel ciblé sur la résistance à l'insuline

La résistance à l'insuline est un état physiopathologique critique qui sous-tend plusieurs maladies chroniques, notamment le diabète de type 2, les maladies cardiovasculaires, l'hypertension et le syndrome des ovaires polykystiques. La résistance à l'insuline se manifeste lorsque le glucose s'accumule dans la circulation sanguine au lieu d'être absorbé par les cellules de l'organisme. Elle résulte d'une diminution de la réponse à l'hormone insuline au niveau du corps entier, des organes ou des cellules.

Un panel de biomarqueurs composé d'un petit acide organique (l'acide α-hydroxybutyrique (AHB)), de deux lipides (l'acide oléique et la linoléoylglycérophosphocholine (LGPC)) et de l'insuline identifie la résistance à l'insuline avec un seul échantillon de sang à jeun et peut avoir une valeur en tant qu'indicateur précoce du risque de développement du prédiabète et du diabète de type 2.

Panel ciblé sur la résistance à l'insuline
Analyse des métaux Panel ciblé

Analyse des métaux Panel ciblé

Le panel ciblé d'analyse des métaux de Metabolon, basé sur l'ICP-MS, fournit des mesures précises des ions métalliques biologiquement importants dans les échantillons biologiques. Outre les problèmes bien établis de toxicité associés à plusieurs métaux, le rôle vital que jouent ces ions dans diverses voies biologiques, que ce soit en catalysant des réactions enzymatiques ou en stabilisant des structures protéiques, est encore en train d'être élucidé. Intimement liés au protéome et au métabolome, les ions métalliques représentent une pièce intrinsèque essentielle à la compréhension globale des phénomènes biologiques, du développement à la maladie en passant par le fonctionnement normal. Sans une compréhension du rôle de ces métaux, une compréhension complète des processus biologiques n'est pas possible. Le panel ciblé d'analyse des métaux mesure une variété d'ions métalliques allant du niveau macro (ppm), y compris Na, K et Ca, au niveau micro (ppb), y compris Mo, Cu et Ni.

Le Metabolon en action

Impact d'une supplémentation en probiotiques sur une faible densité minérale osseuse (DMO)

La métabolomique a permis d'identifier plusieurs biomarqueurs potentiels qui relient les changements dans le microbiote intestinal aux changements dans le métabolisme osseux des femmes vieillissantes.

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Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a compris toute la valeur de la métabolomique, il ne reste plus qu'à savoir qui la pratique le mieux. Si de nombreux laboratoires disposent de capacités de profilage des métabolites ou de chimie analytique, les technologies métabolomiques complètes sont extrêmement rares. L'identification précise et non biaisée des métabolites dans l'ensemble du métabolome pose des problèmes de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de résoudre. En outre, la traduction de quantités massives de données en informations exploitables est lente, voire impossible, pour la plupart des laboratoires, car une interprétation correcte nécessite deux choses qui sont rares : l'expérience et une base de données complète.

Seul Metabolon possède les quatre capacités métabolomiques de base.

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Couverture

Capacité d'interroger des milliers de métabolites dans divers espaces biochimiques, révélant de nouvelles perspectives et opportunités.

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Comparabilité

Capacité à intégrer les données de différentes études dans le même ensemble de données, dans différentes zones géographiques et chez différents patients au fil du temps.

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Compétence

Capacité à informer sur la conception d'une étude appropriée, à générer des données de haute qualité, à obtenir des informations biologiques et à formuler des recommandations exploitables.

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Capacité

Capacité à traiter des centaines de milliers d'échantillons rapidement et à moindre coût pour répondre à une demande en forte croissance

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

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Une bibliothèque de plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 dans le plasma humain, tous référencés dans le contexte des voies biochimiques.

  • C'est 5 fois plus que les métabolites du concurrent le plus proche.
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Une expérience inégalée en matière d'analyse et d'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats significatifs.

  • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
  • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
  • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

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