Pourquoi Metabolon

Machine Learning and Artificial Intelligence

L'utilisation par Metabolonde technologies avancées d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique automatise les tâches de routine afin que nos experts internes puissent concentrer leurs efforts sur les défis scientifiques qui requièrent le plus leur expertise.

Des ensembles de données curées par des experts

Des ensembles de données curées par des experts

Nous avons passé les 20 dernières années à construire la meilleure compétence métabolomique au monde. Aujourd'hui, nous permettons, accélérons et soutenons le développement de médicaments par la découverte de biomarqueurs, la compréhension des mécanismes d'action, la stratification des patients, etc.

Metabolon measures biochemical changes through the study of small molecules to provide a profound understanding of biological systems. Data science enables the continuous improvement of our industry-leading capabilities, allowing us to provide a broader view beyond any other metabolomic provider.

Dans le cadre de nos initiatives en matière de science des données, nous tirons parti de l'intelligence artificielle et des technologies d'apprentissage automatique pour extraire des informations et reconnaître des modèles de données de manière informatique. Les capacités d'apprentissage automatique de Metabolonaméliorent le débit de nos données, identifient les signatures biochimiques et détectent les anomalies afin d'assurer un contrôle de qualité précis et rapide. Notre science des données et nos capacités d'apprentissage automatique permettent d'améliorer la couverture, la qualité, les délais d'exécution, les interprétations et, en fin de compte, la réussite de l'étude pour nos clients.

L'efficacité de l'apprentissage automatique est étroitement liée à la précision, à l'étendue et à la cohérence des données sur lesquelles il est entraîné. Bien avant l'essor de la science des données, les professionnels de Metabolon produisaient des ensembles de données curées par des experts, des analyses statistiques précises et des rapports contenant des informations biologiques approfondies.

Contrôle de qualité rationalisé

In the lab, time is always of the essence, and attention to detail is paramount. Late-stage analysis revealing flaws in original data can invalidate days or weeks of work, de-railing timelines and production deliverables. Machine learning technologies enable us to provide clients with a compressed quality control cycle to detect failure modes much earlier than is possible with a purely manual process.
For example, with several product lines, stringent requirements are tested via statistical analysis once curation is complete. A fully manual process would require several days of work. The auto curation utility, combined with automated statistical analyses targeted at product requirements, has enabled the classification of those samples that would likely fail quality control checks days later. Back-up samples may then be immediately run, decreasing turnaround time for the client and reducing the amount of labor spent on samples doomed to fail at a downstream quality control step.

Metabolon a démontré l'utilité des approches d'apprentissage automatique qui fournissent des résultats se rapprochant d'un post-traitement effectué par des experts. La détection des modes de défaillance immédiatement après la production des données brutes initiales et l'incitation à un examen humain ciblé se traduisent par des gains de temps considérables, une livraison plus rapide du produit moyen et une réduction de la main-d'œuvre, qui peut alors se concentrer sur des résultats de haute qualité plutôt que sur des répétitions.

Reviewing Data
Team in Office Looking at Screens Collaboration

Une curation des données plus rapide

Dans les manuels d'apprentissage automatique, les problèmes d'étiquetage sont résolus par l'apprentissage d'un modèle de classification à partir de données de base impartiales. Dans les applications réelles, cependant, la question peut être considérablement compliquée par les pratiques et les protocoles utilisés pour produire les données d'apprentissage. Par exemple, Metabolon génère des données de spectroscopie de masse LC/MS à partir desquelles la présence de métabolites est déduite. Historiquement, des conservateurs experts ont examiné avec diligence ces données avec l'aide d'un logiciel pour confirmer ou infirmer la présence des composés. Chaque échantillon traité sur nos plateformes est examiné pour vérifier la présence ou l'absence de chacun des plus de 5400 composés de la bibliothèque de référence des métabolites de Metabolon.

L'apprentissage automatique nous permet d'obtenir ces mêmes données de haute qualité, mais beaucoup plus rapidement. Nous pouvons amener un ensemble de données directement au contrôle de qualité grâce à l'apprentissage automatique, ce qui permet de gagner du temps en effectuant automatiquement la curation initiale. L'apprentissage automatique nous permet également de déterminer rapidement et avec certitude les composés présents et ceux qui ne l'ont jamais été, ce qui réduit considérablement, voire élimine, la nécessité de faire appel à des experts humains pour prendre ces décisions.

Basé sur des données historiques, l'apprentissage automatique alimente un utilitaire de curation automatique qui peut curer de nombreux composés de routine. Prenons l'exemple du cholestérol, que l'on trouve facilement dans le plasma humain et qui n'est donc pas une utilisation efficace de l'expertise du personnel pour identifier positivement ce composé. Avec l'aide d'outils d'apprentissage automatique, nous pouvons tirer parti des compétences de nos curateurs experts humains pour rechercher la présence de sulfate d'éthylparabène, qui présente souvent des ions interférents, ou pour différencier des composés tels que l'isoleucylglycine et l'alanylvaline. Ces composés ne sont pas séparés par chromatographie mais présentent une fragmentation MS/MS distincte, contenant généralement une grande variété d'informations.

Poursuite de l'élargissement des connaissances

We’re proud of our metabolite knowledgebase and industry-leading expertise, but we’re not stopping there. There is still much to be discovered in terms of new compounds and their impact on life sciences research and drug development.

We’re committed to unlocking that knowledge to deliver game-changing insights. The body of literature, reports, and insights produced by Metabolon’s scientists have served as the basis for a collaboration with data science to develop a shared vocabulary, a knowledgebase, and software to support the recording of continued knowledge expansion. A

rtificial intelligence and machine learning technologies enable our experts to leverage our vast internal experience of highly curated pathway knowledge, disease profiles, and the world’s best metabolomic insights. Future data science collaborations with these experts will automatically surface relevant historical knowledge to expert staff on each experiment run with Metabolon.

Les technologies d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique sont des ingrédients cruciaux pour la réussite de nos clients. Nous mettons chaque jour ces technologies au service de nos clients pour produire des informations exploitables et introduire plus rapidement de nouvelles thérapies.

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"Chez Metabolon, l'intelligence artificielle et l'apprentissage automatique sont des ingrédients cruciaux pour la réussite de nos clients. Nos approches d'apprentissage automatique ont permis des gains de temps considérables, une livraison moyenne plus rapide des produits et une précision accrue pour nos clients."

William LeFew, Ph.D.

Director, Data Science

Découvrez comment Metabolon peut vous aider à obtenir des informations précliniques et cliniques.

Un scientifique travaille avec un spectromètre de masse

Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a pris la mesure de toute la valeur de la métabolomique, la seule question qui reste est la suivante : qui la maîtrise le mieux ? Si de nombreux laboratoires disposent de capacités en matière de profilage métabolique ou de chimie analytique, les technologies de métabolomique complètes sont extrêmement rares.

L'identification précise et impartiale des métabolites à l'échelle de l'ensemble du métabolome pose des défis en matière de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de relever. De plus, la transformation de quantités massives de données en informations exploitables est un processus lent, voire impossible, pour la plupart d'entre eux, car une interprétation correcte nécessite deux éléments qui font défaut : l'expérience et une base de données exhaustive.

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

  • Une base de données comprenant plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 présents dans le plasma humain, tous répertoriés dans le cadre des voies biochimiques. Cela représente cinq fois plus de métabolites que chez le concurrent le plus proche.
  • Une expérience d'une ampleur et d'une profondeur inégalées dans l'analyse et l'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats pertinents
    • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
    • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
    • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

Metabolon la seule entreprise Metabolon des quatre compétences fondamentales en métabolomique :

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