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Pourquoi Metabolon?

Apprentissage automatique et intelligence artificielle

L'utilisation par Metabolonde technologies avancées d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique automatise les tâches de routine afin que nos experts internes puissent concentrer leurs efforts sur les défis scientifiques qui requièrent le plus leur expertise.

Des ensembles de données curées par des experts

Nous avons passé les 20 dernières années à construire la meilleure compétence métabolomique au monde. Aujourd'hui, nous permettons, accélérons et soutenons le développement de médicaments par la découverte de biomarqueurs, la compréhension des mécanismes d'action, la stratification des patients, etc.

Metabolon mesure les changements biochimiques par l'étude de petites molécules afin de fournir une compréhension approfondie des systèmes biologiques. La science des données permet l'amélioration continue de nos capacités de pointe, ce qui nous permet d'offrir une vision plus large que celle de n'importe quel autre fournisseur de services métabolomiques.

Dans le cadre de nos initiatives en matière de science des données, nous tirons parti de l'intelligence artificielle et des technologies d'apprentissage automatique pour extraire des informations et reconnaître des modèles de données de manière informatique. Les capacités d'apprentissage automatique de Metabolonaméliorent le débit de nos données, identifient les signatures biochimiques et détectent les anomalies afin d'assurer un contrôle de qualité précis et rapide. Notre science des données et nos capacités d'apprentissage automatique permettent d'améliorer la couverture, la qualité, les délais d'exécution, les interprétations et, en fin de compte, la réussite de l'étude pour nos clients.

L'efficacité de l'apprentissage automatique est étroitement liée à la précision, à l'étendue et à la cohérence des données sur lesquelles il est entraîné. Bien avant l'essor de la science des données, les professionnels de Metabolon produisaient des ensembles de données curées par des experts, des analyses statistiques précises et des rapports contenant des informations biologiques approfondies.

Des ensembles de données curées par des experts
Contrôle de qualité rationalisé

Contrôle de qualité rationalisé

En laboratoire, le temps est toujours compté et le souci du détail est primordial. Une analyse tardive révélant des failles dans les données d'origine peut invalider des jours ou des semaines de travail, faisant dérailler les calendriers et les livrables de production. Les technologies d'apprentissage automatique nous permettent d'offrir à nos clients un cycle de contrôle de la qualité comprimé afin de détecter les modes de défaillance bien plus tôt que ne le permettrait un processus purement manuel.

Par exemple, avec plusieurs lignes de produits, les exigences strictes sont testées par le biais d'une analyse statistique une fois la curation terminée. Un processus entièrement manuel nécessiterait plusieurs jours de travail. L'utilitaire de curation automatique, combiné à des analyses statistiques automatisées ciblées sur les exigences du produit, a permis de classer les échantillons susceptibles d'échouer aux contrôles de qualité quelques jours plus tard. Les échantillons de réserve peuvent alors être immédiatement analysés, ce qui réduit les délais d'exécution pour le client et la quantité de travail consacrée aux échantillons voués à l'échec lors d'une étape de contrôle de la qualité en aval.

Metabolon a démontré l'utilité des approches d'apprentissage automatique qui fournissent des résultats se rapprochant d'un post-traitement effectué par des experts. La détection des modes de défaillance immédiatement après la production des données brutes initiales et l'incitation à un examen humain ciblé se traduisent par des gains de temps considérables, une livraison plus rapide du produit moyen et une réduction de la main-d'œuvre, qui peut alors se concentrer sur des résultats de haute qualité plutôt que sur des répétitions.

Une curation des données plus rapide

Dans les manuels d'apprentissage automatique, les problèmes d'étiquetage sont résolus par l'apprentissage d'un modèle de classification à partir de données de base impartiales. Dans les applications réelles, cependant, la question peut être considérablement compliquée par les pratiques et les protocoles utilisés pour produire les données d'apprentissage. Par exemple, Metabolon génère des données de spectroscopie de masse LC/MS à partir desquelles la présence de métabolites est déduite. Historiquement, des conservateurs experts ont examiné avec diligence ces données avec l'aide d'un logiciel pour confirmer ou infirmer la présence des composés. Chaque échantillon traité sur nos plateformes est examiné pour vérifier la présence ou l'absence de chacun des plus de 5400 composés de la bibliothèque de référence des métabolites de Metabolon.

L'apprentissage automatique nous permet d'obtenir ces mêmes données de haute qualité, mais beaucoup plus rapidement. Nous pouvons amener un ensemble de données directement au contrôle de qualité grâce à l'apprentissage automatique, ce qui permet de gagner du temps en effectuant automatiquement la curation initiale. L'apprentissage automatique nous permet également de déterminer rapidement et avec certitude les composés présents et ceux qui ne l'ont jamais été, ce qui réduit considérablement, voire élimine, la nécessité de faire appel à des experts humains pour prendre ces décisions.

Basé sur des données historiques, l'apprentissage automatique alimente un utilitaire de curation automatique qui peut curer de nombreux composés de routine. Prenons l'exemple du cholestérol, que l'on trouve facilement dans le plasma humain et qui n'est donc pas une utilisation efficace de l'expertise du personnel pour identifier positivement ce composé. Avec l'aide d'outils d'apprentissage automatique, nous pouvons tirer parti des compétences de nos curateurs experts humains pour rechercher la présence de sulfate d'éthylparabène, qui présente souvent des ions interférents, ou pour différencier des composés tels que l'isoleucylglycine et l'alanylvaline. Ces composés ne sont pas séparés par chromatographie mais présentent une fragmentation MS/MS distincte, contenant généralement une grande variété d'informations.

Une curation des données plus rapide
Poursuite de l'élargissement des connaissances

Poursuite de l'élargissement des connaissances

Nous sommes fiers de notre base de connaissances sur les métabolites et de notre expertise de pointe, mais nous ne nous arrêtons pas là. Il reste encore beaucoup à découvrir en termes de nouveaux composés et d'impact sur la recherche en sciences de la vie et le développement de médicaments. Nous nous engageons à exploiter ces connaissances afin de fournir des informations qui changeront la donne. L'ensemble de la littérature, des rapports et des idées produites par les scientifiques de Metabolonont servi de base à une collaboration avec la science des données pour développer un vocabulaire partagé, une base de connaissances et un logiciel pour soutenir l'enregistrement de l'expansion continue des connaissances. Les technologies d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique permettent à nos experts de tirer parti de notre vaste expérience interne en matière de connaissance des voies pathologiques, de profils de maladies et des meilleures connaissances métabolomiques au monde. Les futures collaborations avec ces experts dans le domaine de la science des données feront automatiquement remonter à la surface les connaissances historiques pertinentes pour le personnel expert lors de chaque expérience réalisée avec Metabolon.

Les technologies d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique sont des ingrédients cruciaux pour la réussite de nos clients. Nous mettons chaque jour ces technologies au service de nos clients pour produire des informations exploitables et introduire plus rapidement de nouvelles thérapies.

"Chez Metabolon, l'intelligence artificielle et l'apprentissage automatique sont des ingrédients cruciaux pour la réussite de nos clients. Nos approches d'apprentissage automatique ont permis des gains de temps considérables, une livraison moyenne plus rapide des produits et une précision accrue pour nos clients."
WILLIAM LEFEW, PH.D.
DIRECTEUR, SCIENCE DES DONNÉES

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Pourquoi Metabolon?

Une fois que l'on a compris toute la valeur de la métabolomique, il ne reste plus qu'à savoir qui la pratique le mieux. Si de nombreux laboratoires disposent de capacités de profilage des métabolites ou de chimie analytique, les technologies métabolomiques complètes sont extrêmement rares. L'identification précise et non biaisée des métabolites dans l'ensemble du métabolome pose des problèmes de rapport signal/bruit que très peu de laboratoires sont en mesure de résoudre. En outre, la traduction de quantités massives de données en informations exploitables est lente, voire impossible, pour la plupart des laboratoires, car une interprétation correcte nécessite deux choses qui sont rares : l'expérience et une base de données complète.

Seul Metabolon possède les quatre capacités métabolomiques de base.

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Couverture

Capacité d'interroger des milliers de métabolites dans divers espaces biochimiques, révélant de nouvelles perspectives et opportunités.

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Comparabilité

Capacité à intégrer les données de différentes études dans le même ensemble de données, dans différentes zones géographiques et chez différents patients au fil du temps.

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Compétence

Capacité à informer sur la conception d'une étude appropriée, à générer des données de haute qualité, à obtenir des informations biologiques et à formuler des recommandations exploitables.

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Capacité

Capacité à traiter des centaines de milliers d'échantillons rapidement et à moindre coût pour répondre à une demande en forte croissance

Partenaire de Metabolon pour l'accès :

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Une bibliothèque de plus de 5 400 métabolites connus, dont 2 000 dans le plasma humain, tous référencés dans le contexte des voies biochimiques.

  • C'est 5 fois plus que les métabolites du concurrent le plus proche.
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Une expérience inégalée en matière d'analyse et d'interprétation des données métabolomiques afin d'obtenir des résultats significatifs.

  • Plus de 10 000 projets avec des centaines de clients
  • Plus de 3 500 publications couvrant 500 maladies, dont de nombreuses revues à comité de lecture telles que Cell, Nature et Science.
  • Près de 40 docteurs en science des données, en biologie moléculaire et en biochimie

Grâce à notre plateforme robuste et à nos outils de visualisation, nos experts sont en mesure de vous en dire plus sur votre molécule et de développer des panels d'essais pour vous aider à obtenir les résultats dont vous avez besoin.

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Références

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