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Impact Explorer & Heliogram™

Visualisez vos données de manière pertinente, contextuelle et attrayante dans de multiples domaines d'intérêt. Exploitez la base de connaissances de Metabolonpour obtenir des vues vraiment pertinentes de données métabolomiques profondément annotées.

Notre visualisation Heliogram™ exclusive vous permet de voir en profondeur les impacts des voies métaboliques et leurs effets associés sur la santé humaine. Comparez facilement jusqu'à six groupes d'étude à la fois pour l'impact des voies métaboliques, l'importance et les associations. Changez la façon dont vous visualisez la métabolomique grâce à la base de données d'annotations de métabolites la plus riche et la plus biologiquement pertinente.

Légende de la visualisation

Anneau extérieur : Métabolites

L'anneau extérieur de la visualisation Heliogram™ est constitué des métabolites du panneau de découverte. L'anneau extérieur peut afficher jusqu'à six comparaisons statistiques à la fois, ce qui vous permet de comparer vos résultats et de visualiser les tendances ou les contrastes.

Anneau intérieur : Associations

L'anneau intérieur de la visualisation Heliogram™ est constitué d'associations basées sur des annotations.Chaque nœud représente une association, classée par ordre alphabétique. La barre située à côté de chaque nœud indique le pourcentage de résultats significatifs au sein de l'association.

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Associations

L'anneau extérieur de l'Heliogram™ visualise les comparaisons statistiques (un groupe comparé à un autre) pour chaque métabolite du panneau de découverte. Sélectionnez la ou les comparaisons à afficher à l'aide du menu déroulant "Select Comparison". Ici, vous verrez les comparaisons de groupe définies par votre plan d'étude. Vous pouvez sélectionner jusqu'à six comparaisons à afficher en même temps, disposées et ordonnées selon la séquence de leur sélection.

Ce curseur vous permet d'ajuster la limite de la signification statistique (valeur p) affichée dans les tableaux de visualisation et de classification. En glissant vers la droite, vous élargissez la plage de signification, tandis qu'en glissant vers la gauche, vous réduisez la plage aux métabolites les plus statistiquement significatifs pour la comparaison choisie.

Les valeurs p pour chaque comparaison sont dérivées des données transformées en logarithme naturel à l'aide de l'analyse statistique correspondante (par exemple, test t, ANOVA, etc.).

Utilisez ce menu déroulant pour trouver ou rechercher un métabolite ou une association particulière à partir du panneau de découverte. Une fois sélectionné, le métabolite ou l'association sera mis en évidence dans la visualisation.

Le survol d'un carré de la carte thermique ou d'un cercle de métabolite permet d'afficher ce métabolite. Une bordure apparaît autour des carrés de la carte thermique, tandis que tous les autres carrés s'effacent en arrière-plan. Une ligne (ou un ensemble de lignes) est tracée pour relier le métabolite à ses associations. Le nom du métabolite apparaît au centre. En outre, un tableau apparaît au centre et répertorie les associations liées au métabolite sélectionné. Le tableau comprend un pourcentage significatif (% sig). Ce pourcentage est calculé en prenant tous les métabolites liés à l'association (et pas seulement celui qui est survolé) et toutes les comparaisons visibles, et en comptant combien sont significatives. Par exemple, si l'association "voie a" est associée à 2 métabolites et que 6 comparaisons ont été sélectionnées, le dénominateur sera de 12 (2 x 6). Le numérateur serait calculé en prenant le nombre de comparaisons significatives sur les 12, par exemple 3, ce qui signifie que la métrique indiquerait 3 / 12, soit 25 %. L'objectif de cette métrique est de voir si le métabolite survolé a des résultats similaires à ceux d'autres métabolites apparentés.

Le survol d'un cercle ou d'une barre d'association fait apparaître cette association. Une série de lignes est tracée depuis l'association jusqu'aux métabolites apparentés. Les métabolites apparentés restent totalement opaques, tandis que tout le reste s'estompe. Les noms des métabolites sont ajoutés à l'extérieur de la visualisation. Le nom de l'association apparaît au centre. En outre, un tableau énumérant les métabolites associés apparaît. Le tableau comprend une métrique "total significatif". Cette mesure est calculée en comptant le nombre de comparaisons significatives (valeur p inférieure au seuil de la valeur p). Par exemple, si 3 comparaisons sur 6 sont significatives, le total significatif indiquera 3.

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Références

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