Glossaire des produits

Ce glossaire définit les termes courants que vous pouvez rencontrer lorsque vous travaillez sur le portailMyMetabolon ou dans notre centre d'aide.

A

ANOVA Effet principal : L'effet d'une variable indépendante sur une variable dépendante, moyenné sur les niveaux de toutes les autres variables indépendantes.

Association : Une connexion ou un lien de coopération entre deux choses. Les associations du panel de découverte sont soutenues par des annotations approfondies et des références littéraires.

C

CDT : fichier(s) de données tabulaire(s) contenant les résultats du projet, y compris l'identifiant chimique et l'annotation.

COMP ID : Un identifiant de composé Metabolon généré en interne.

D

Données livrables : Le(s) fichier(s) ou les données que l'utilisateur peut exporter ou télécharger. Exemple : CDT

Panel de découvertes : Une collection de composés et de voies dérivés du Metabolon Global Discovery Panel. Ces collections sont axées sur des domaines spécifiques de la fonction biologique, de l'état pathologique et de l'application commerciale.

Projet d'association de métabolites du Discovery Panel (MAP) : Une base de données contenant des informations associatives contextuelles pertinentes pour les composés du Global Discovery Panel. Ce fichier contient des données collectées et validées par le groupe Metabolon Discovery and Translational Science (DTS).

Annotations sur les voies du Discovery Panel : Informations sur les voies fonctionnelles créées et mises à jour par le groupe Metabolon Discovery and Translational Science, qui détaillent les informations biologiques pertinentes dans le contexte du groupe de découverte global au niveau des voies. Chaque annotation de voie contient un diagramme de voie, des notes fonctionnelles, des notes d'impact et des liens vers des références bibliographiques pertinentes.

DTS : Discovery and Translational Science (découverte et science translationnelle). Le département de Metabolon est responsable de l'interprétation biologique.

G

Panel de découverte global : La technologie globale de métabolomique par chromatographie liquide et spectrométrie de masse (LC-MS) de Metabolonfournit une analyse reproductible de haute fidélité de l'état actuel d'un système biologique. Cette technologie utilise quatre méthodes analytiques (Pos Late, Pos Early, Polar et Neg) pour identifier jusqu'à plus de 5 400 métabolites dans 70 voies biochimiques majeures.

H

HMDB : Un identifiant alphanumérique de composé et un lien vers des informations sur les composés gérés par la base de données du métabolome humain (HMDB).

K

Identifiant KEGG : Un identifiant alphanumérique du composé et un lien vers les informations sur le composé dans l'encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes (KEGG).

L

LC-MS : La chromatographie liquide-spectrométrie de masse (LC-MS) est une technique de chimie analytique qui combine les capacités de séparation physique de la chromatographie liquide à haute performance (HPLC) avec les capacités d'analyse de masse de la spectrométrie de masse (MS). La chromatographie liquide (CL) sépare les composants de l'échantillon et les introduit dans le spectromètre de masse (SM). Le SM crée et détecte des ions chargés. Les données LC/MS peuvent être utilisées pour fournir des informations sur le poids moléculaire, la structure, l'identité et la quantité de composants spécifiques de l'échantillon.

LIMS : Système de gestion des informations de laboratoire

M

Matrice : En analyse chimique, une matrice fait référence au type d'échantillon (par exemple, sérum, fèces, etc.).

Métabolite : En biochimie, un métabolite est un composé chimique qui est un produit intermédiaire ou final du métabolisme. Le terme métabolite est généralement utilisé pour les petites molécules. (par exemple, l'éthanol, l'acide glutamique, etc.)

MyMetabolon (Portail) : Portail des clients de Metabolon :metabolon

P

Valeur p : les valeurs p pour chaque comparaison sont dérivées des données transformées en logarithme naturel à l'aide de l'analyse statistique correspondante (par exemple, test t, ANOVA, etc.). La valeur p est la probabilité que la statistique du test soit au moins aussi extrême que celle observée dans l'expérience actuelle, étant donné que l'hypothèse nulle est vraie. Par conséquent, plus la statistique est extrême, plus la valeur p est faible et plus les données fournissent des preuves contre l'hypothèse nulle.

Voie métabolique : Une voie métabolique est une série de réactions chimiques liées entre elles qui se produisent à l'intérieur d'une cellule. Les réactifs, les produits et les intermédiaires d'une réaction enzymatique sont appelés métabolites, qui sont modifiés par une séquence de réactions chimiques catalysées par des enzymes.

Pourcentage de remplissage : pourcentage total d'échantillons d'un groupe expérimental dans lesquels un métabolite a été détecté.

PUBCHEM : PubChem Compound Identification ; identifiant numérique unique attribué par le National Center for Biotechnology Information (NCBI) et consultable dans la base de données PubChem.

R

Données brutes sur les pics : La hauteur du pic est définie comme l'intensité maximale de tous les points de données formant le pic, et la surface du pic est mesurée comme la somme des intensités de tous les points de données.

S

Conception de l'étude : La conception de l'étude est un processus dans lequel la méthodologie de l'essai et l'analyse statistique sont organisées pour garantir que l'hypothèse nulle est acceptée ou rejetée et que les conclusions reflètent la vérité.

Sous-voie : Une voie biochimique liée à une fonction biologique spécifique.

Super voie : Combinaison de voies biochimiques décrivant la biosynthèse ou le métabolisme d'un groupe de composés apparentés.

T

Panel ciblé : Panel ciblé pour des voies et des métabolites spécifiques qui fournissent une quantification absolue pour la recherche et les applications de biomarqueurs. Chaque panel est configuré et validé indépendamment pour des méthodes analytiques et des matrices spécifiques.

ANOVA à deux voies : dans l'analyse de la variance à deux voies (ANOVA), trois tests statistiques sont généralement effectués : l'effet principal de chaque facteur indépendamment et l'effet de l'interaction.

V

Visualisation : La représentation graphique d'informations et de données.

Désignation pour l'usage exclusif de la recherche

L'expression "Research Use Only" ou "RUO" fait référence aux produits et services proposés par Metabolon qui sont utilisés uniquement à des fins de recherche et non à des fins de diagnostic. Tous les produits et services RUO sont conformes à la norme ISO 9001:2015.